如果亲子鉴定中全部使用母亲的样本进行检测，将无法得出有效的亲子关系结论。以下从不同角度进行详细分析：
亲子鉴定的基本原理：
- 亲子鉴定是通过比较被鉴定人与已知亲属（通常是父母）的遗传标记（如DNA片段）来确定亲子关系的。
- 在标准的亲子鉴定中，需要同时采集父亲、母亲和孩子的样本，通过比对三者的遗传标记来确认亲子关系。这是因为孩子从父母那里各继承了一半的遗传物质，通过比对可以明确这种继承关系。
全部使用母亲样本的后果：
- 如果亲子鉴定中全部使用母亲的样本，那么只能确认孩子与母亲之间的遗传关系，而无法确认孩子与父亲之间的遗传关系。
- 由于缺少父亲的样本，无法进行完整的遗传标记比对，因此无法得出有效的亲子关系结论。这种鉴定结果在法律上是不被认可的，因为它没有满足亲子鉴定的基本要求。
可能的法律后果：
- 在涉及亲子关系的法律纠纷中（如抚养权争议、继承权争议等），亲子鉴定结果往往是关键证据。
- 如果亲子鉴定结果无效或无法得出明确结论，可能会导致法律纠纷无法顺利解决，甚至可能引发更多的争议和诉讼。
- 在某些情况下，如果一方故意提供错误的样本或拒绝提供样本进行亲子鉴定，可能会承担相应的法律责任。
实际操作中的建议：
- 在进行亲子鉴定时，应确保按照正规程序采集所有必要样本（父亲、母亲和孩子）。
- 如果一方拒绝提供样本或无法提供样本，应咨询专业律师以了解可能的法律后果和解决方案。
- 亲子鉴定应选择具有合法资质和良好信誉的鉴定机构进行，以确保鉴定结果的准确性和法律效力。
总结来说，亲子鉴定中全部使用母亲的样本进行检测是无法得出有效亲子关系结论的。在进行亲子鉴定时，应确保采集所有必要样本，并选择正规鉴定机构进行鉴定。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。