如果进行亲子鉴定时，两个样本都是妈妈的，那么鉴定结果将无法得出有效的亲子关系结论。以下从几个方面进行详细解释：

1. 亲子鉴定的基本原理：

   • 亲子鉴定主要是通过比较被鉴定人（如孩子）与疑似父母（如父亲或母亲）的DNA序列，来确定他们之间是否存在生物学上的亲子关系。
   • DNA是每个人独特的遗传物质，除了同卵双胞胎外，每个人的DNA序列都是独一无二的。亲子鉴定通过检测特定的DNA片段（如STR位点）来进行分析。

2. 两个样本都是妈妈的情况：

   • 在这种情况下，由于两个样本都来自妈妈，它们之间的DNA序列将高度相似或完全相同（取决于检测的DNA片段和妈妈的遗传多样性）。
   • 亲子鉴定需要比较的是孩子与疑似父母之间的DNA差异，以确定是否存在亲子关系。如果两个样本都是妈妈的，那么就无法通过比较来得出孩子与父亲之间的亲子关系结论。

3. 可能的鉴定结果：

   • 鉴定机构可能会出具一份无法得出明确结论的报告，说明由于两个样本都是妈妈的，无法确定孩子与父亲之间的亲子关系。
   • 在某些情况下，如果鉴定机构能够检测到足够的遗传信息差异（尽管这种情况非常罕见，且通常不是通过常规亲子鉴定方法实现的），可能会尝试给出一些推测性的结论，但这通常是不准确且不可靠的。

4. 实际应用中的建议：

   • 如果需要进行亲子鉴定以确定孩子与父亲之间的关系，应该确保提供孩子和父亲的样本，而不是两个妈妈的样本。
   • 如果由于特殊原因（如父亲无法提供样本）只能提供妈妈的样本，那么亲子鉴定将无法得出有效的结论。在这种情况下，可能需要考虑其他方法（如家族谱系分析、遗传咨询等）来辅助确定亲子关系。

总结来说，亲子鉴定需要比较孩子与疑似父母之间的DNA差异来确定亲子关系。如果两个样本都是妈妈的，那么鉴定结果将无法得出有效的亲子关系结论。因此，在进行亲子鉴定时，请确保提供正确的样本组合。如果你有任何关于亲子鉴定或婚姻家庭方面的法律问题，都可以直接向我咨询。