公司账户被起诉冻结后，原则上不能收款，但存在例外情形。具体分析如下：

1. 冻结期间的账户功能限制
   根据《民事诉讼法》第106条及《最高人民法院关于人民法院民事执行中查封、扣押、冻结财产的规定》，法院冻结银行账户后，账户内资金将被限制支取、划转或设置权利负担，但未明确禁止资金入账。然而，实践中银行系统通常会对冻结账户实施“只进不出”或“不进不出”的管控措施：

   • “只进不出”：账户可接收款项，但无法支取或转账；
     
   • “不进不出”：账户既无法收款也无法付款。
     具体采取哪种方式，取决于法院冻结裁定中的要求或银行内部操作规范。若法院未特别说明，银行可能默认采取更严格的“不进不出”措施。

2. 例外情形：法院允许部分收款
   若公司能证明冻结账户内的资金属于特定用途（如员工工资、社保缴纳、税款支付等），可依据《民事诉讼法》第107条向法院申请“活封”（即允许账户在冻结状态下接收特定款项）。此时需提交：

   • 资金用途证明（如劳动合同、社保缴费记录、税务申报表）；
     
   • 资金使用计划（如工资发放表、税款计算表）；
     
   • 担保措施（如提供等值财产担保或第三方保证）。
     法院审查后，可能裁定允许账户接收与特定用途相关的款项，但需确保资金专款专用，不得挪作他用。

3. 收款后的法律风险
   即使账户被允许收款，仍需注意：

   • 资金混同风险：若收款资金与账户内原有冻结资金混同，可能导致新入账资金被一并冻结；
     
   • 执行优先权：若公司存在其他债权人，新入账资金可能被其他法院轮候冻结或优先执行；
     
   • 恶意转移财产嫌疑：若公司通过虚构交易等方式转移资金，可能被认定为规避执行，面临罚款、拘留甚至刑事责任。

建议：若公司账户被冻结且需收款，应第一时间联系执行法院，明确冻结措施的具体范围及是否允许部分收款。若需申请“活封”，应准备完整证据材料并严格遵守法院裁定要求。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作流程及风险防范措施。