结论前置：店主从正规批发市场进货后被市场监督管理局认定为侵标侵权，店主可以通过核实侵权事实、收集证据、与市场监督管理局沟通、申请行政复议或提起行政诉讼等步骤来维护自身权益。以下是对此问题的详细分析：

1. 核实侵权事实：

   • 店主应首先核实市场监督管理局所认定的侵权事实是否准确。这包括确认所售商品是否确实存在商标侵权问题，以及该侵权行为是否与店主直接相关。
   • 店主可以要求市场监督管理局提供详细的侵权证据，如商标注册证书、侵权商品的照片或样品等，以便进行比对和核实。

2. 收集证据：

   • 若店主认为自身并未侵权，应积极收集证据以证明自身清白。这包括但不限于进货合同、发票、商品来源证明、商标使用授权书等。
   • 店主还可以收集其他能够证明自身未侵权的证据，如与供应商的沟通记录、商品质量检测报告等。

3. 与市场监督管理局沟通：

   • 在收集到足够证据后，店主应主动与市场监督管理局进行沟通，说明自身情况，并提供相关证据。
   • 店主可以请求市场监督管理局重新审查侵权事实，或者提出听证申请，以便在听证会上进一步阐述自身观点和提供证据。

4. 申请行政复议或提起行政诉讼：

   • 若市场监督管理局仍然认定店主侵权，并作出了相应的行政处罚决定，店主可以在法定期限内申请行政复议或提起行政诉讼。
   • 行政复议：根据《中华人民共和国行政复议法》的相关规定，店主可以向作出行政处罚决定的市场监督管理局的上一级主管部门申请行政复议，请求撤销或变更原行政处罚决定。
   • 行政诉讼：若店主对行政复议结果不服，或者未选择行政复议而直接选择诉讼途径，可以在法定期限内向人民法院提起行政诉讼，请求法院判决撤销或变更原行政处罚决定。

5. 法律后果与应对策略：

   • 若店主最终被认定侵权，将可能面临罚款、没收侵权商品等行政处罚。此时，店主应积极配合市场监督管理局的执行工作，并考虑与权利人进行协商，寻求和解或赔偿等解决方案。
   • 若店主认为自身权益受到侵害，如市场监督管理局的行政处罚决定存在错误或不当之处，店主还可以通过法律途径寻求救济，如提起国家赔偿诉讼等。

特别提醒：在整个过程中，店主应保持冷静和理性，积极配合市场监督管理局的调查工作，并妥善保管好所有相关证据和文件。同时，店主也可以考虑咨询专业律师（即我本人，谢万扬律师，专注于公司事务、经济纠纷领域）的意见，以便更好地维护自身权益。