申请执行人要求被执行人股东承担补充赔偿责任，是适用时效的。以下从多个角度对此问题进行详细分析：
一、法律依据与时效规定
根据《中华人民共和国民法典》及相关司法解释，债权请求权通常受到诉讼时效的限制。在申请执行人要求被执行人股东承担补充赔偿责任的情境中，这一请求权本质上属于债权请求权，因此应当适用诉讼时效的规定。一般来说，诉讼时效期间为三年，自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。
二、时效的适用情形
股东未履行或未全面履行出资义务：
- 若被执行人的股东未履行或未全面履行出资义务，导致公司财产不足以清偿债务，申请执行人有权要求该股东在未出资本息范围内对公司债务不能清偿的部分承担补充赔偿责任。
- 在此情形下，申请执行人要求股东承担补充赔偿责任的请求权，自其知道或应当知道股东未履行出资义务之日起计算诉讼时效。
股东抽逃出资：
- 若股东抽逃出资，导致公司财产减少，进而影响公司偿债能力，申请执行人同样有权要求该股东在抽逃出资本息范围内对公司债务不能清偿的部分承担补充赔偿责任。
- 诉讼时效的计算起点为申请执行人知道或应当知道股东抽逃出资之日。
三、时效的中断与中止
- 时效中断：在诉讼时效期间内，若申请执行人向股东提出履行请求、股东同意履行义务或申请执行人提起诉讼或申请仲裁等，均可能导致诉讼时效中断。中断后，诉讼时效期间重新计算。
- 时效中止：在诉讼时效期间的最后六个月内，若因不可抗力或其他障碍不能行使请求权，诉讼时效中止。自中止时效的原因消除之日起满六个月，诉讼时效期间届满。
四、实务建议
- 及时行使权利：申请执行人应在知道或应当知道股东存在未履行出资义务、抽逃出资等情形后，及时行使权利，要求股东承担补充赔偿责任，以避免诉讼时效过期。
- 保留证据：申请执行人应保留好相关证据，如股东未履行出资义务或抽逃出资的证据、公司财产不足以清偿债务的证据等，以便在诉讼中证明自己的主张。
- 咨询专业律师：在涉及复杂法律问题时，申请执行人应及时咨询专业律师，以获取更具体的法律建议和指导。
总结来说，申请执行人要求被执行人股东承担补充赔偿责任是适用时效的。申请执行人应了解并遵守诉讼时效的规定，及时行使权利并保留好相关证据。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。