根据您描述的单位车间火灾造成九十多万损失且被认定为一般事故的情况，应急管理部门罚款金额需结合具体违法情形判断，以下是分情况说明：
基础罚款区间（10万-50万元）
根据《安全生产法》第114条，发生一般生产安全事故的，对负有责任的生产经营单位处30万-100万元罚款。但若存在”未建立安全风险分级管控制度”、”未如实记录安全生产教育情况”等《安全生产违法行为行政处罚办法》第45条列举的违法行为，即使未直接导致事故，也可能按该办法第45条处1万-3万元/项的罚款，与事故罚款叠加计算。
从重处罚情形（50万-100万元）
若存在以下情形之一，罚款可能接近上限：
- 事故后未立即启动应急预案（违反《生产安全事故应急条例》第34条）
- 隐瞒事故关键信息（违反《生产安全事故报告和调查处理条例》第36条）
- 3年内曾因同类违法行为受过处罚（《安全生产法》第113条加重情节）
- 事故单位属于高危行业领域（如化工、矿山等）
- 特殊情形说明
- 若火灾由第三方承包商违规操作引发，根据《民法典》第1193条，发包单位可能因选任过失承担部分责任，但应急罚款仍针对直接责任单位
- 若单位已投保安全生产责任险，保险公司赔付不影响行政处罚，但部分地区允许将保险赔付作为从轻处罚情节
- 2021年新修订的《安全生产法》实施后，罚款基数普遍提高30%，需注意事故发生时间对法律适用的影响
建议行动方案：
- 立即整理事故调查报告、安全管理制度文件、设备维护记录等材料
- 重点核查是否存在”未按规定设置安全警示标志”、”未配备消防设施”等具体违法行为
- 在收到《行政处罚告知书》后3日内可申请听证，对违法事实认定、处罚幅度提出陈述申辩
如需进一步分析具体违法条款或准备听证材料，可提供事故调查报告关键内容，我将为您制定针对性应对策略。