《中华人民共和国海上交通安全法》主要适用于通航水域，对于非通航水域，该法并不直接适用。以下是对这一问题的详细分析：
一、法律适用范围
《中华人民共和国海上交通安全法》的适用范围广泛，但主要聚焦于通航水域，包括：
中华人民共和国内水：如港口、河流入海口、内海湾、内海峡等位于领海基线以内的海域，这些水域是海上交通活动的重要区域，受该法严格约束。
领海、毗连区、专属经济区：这些区域同样属于通航水域范畴，船舶的航行、停泊、作业等活动必须遵守该法规定，以保障海上交通安全。
二、非通航水域的法律适用
对于非通航水域，如某些封闭的内陆湖泊、河流的非通航段等，由于这些区域通常不涉及海上交通活动，因此《海上交通安全法》并不直接适用。然而，这并不意味着这些水域的交通安全不受法律保护。实际上，非通航水域的交通安全可能由其他相关法律法规进行规范，如《内河交通安全管理条例》等，这些法规针对内河等非通航水域的特定情况，制定了相应的安全管理措施。
三、特殊情况说明
虽然《海上交通安全法》主要适用于通航水域，但在特定情况下，如军事需要、海上搜救等，该法也可能间接涉及非通航水域的交通安全问题。此外，如果非通航水域因某种原因（如施工、航道变更等）临时变为通航水域，那么在该期间内，这些水域也将受《海上交通安全法》的约束。
四、法律建议
了解水域性质：在进行任何水上活动前，应首先了解所在水域的性质（通航或非通航），以便确定适用的法律法规。
遵守相关法规：无论水域性质如何，都应遵守当地的水上交通安全法规，确保自身和他人的安全。
咨询专业人士：对于不确定的水域或复杂的法律问题，建议咨询专业的法律人士或相关部门，以获取准确的法律指导和建议。
如果您在海上交通安全方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。我将根据您的具体情况，提供专业、全面的法律服务。