垫付款项的诉讼时效计算起点需根据具体法律关系及权利主张方式确定，核心结论如下：

1. 基础法律关系为借款/合同之债时
   诉讼时效自权利人知道或应当知道权利被侵害之日起算。具体表现为：

   • 若约定还款期限：自还款期限届满次日起算（如借条约定2023年1月1日还款，则时效从2023年1月2日起算）；
     
   • 若未约定还款期限：自债权人首次要求债务人履行并给予合理宽限期后，宽限期届满次日起算（《民法典》第188条、第675条）。
     例外情形：若债务人明确表示拒绝履行（如书面否认债务），则时效自拒绝之日起算。

2. 基础法律关系为无因管理时
   诉讼时效自管理事务终止之日起算（《民法典》第979条）。例如：

   • 甲为乙垫付医疗费后，乙康复出院（管理事务终止）的次日，甲若主张返还垫付款，时效开始计算；
     
   • 若管理事务处于持续状态（如长期代为保管财产），则时效自最终处理完毕之日起算。

3. 基础法律关系为不当得利时
   诉讼时效自权利人知道或应当知道不当得利事实及义务人之日起算（《民法典》第122条、第188条）。例如：

   • 甲误将款项汇入乙账户，自甲收到银行错误通知（知道不当得利事实）的次日，时效开始计算；
     
   • 若甲长期未察觉错误，则时效自甲实际应当发现错误之日起算（如通过账户对账发现异常）。

关键风险提示：

• 诉讼时效为3年，自上述起算点至权利人首次主张权利之日超过3年的，债务人可提出时效抗辩；
  
• 诉讼时效可因权利人向义务人提出履行请求、义务人同意履行、提起诉讼或申请仲裁等情形而中断，中断后重新计算3年；
  
• 实践中需结合垫付凭证（如转账记录、借条、沟通记录等）固定权利主张时间点，避免因证据缺失导致时效争议。

建议行动：
若涉及具体案件，需进一步审查垫付背景、双方约定、权利主张记录等材料，以精准确定时效起算点及中断事由。可直接提供详细信息，我将结合证据链分析时效风险。