1. 核心结论：在农村仅有两家银行且还款金额超50万的情况下，需根据债务性质（如是否为同一债权人、是否为同一法律关系下的债务）、债务人资产状况及偿债能力等因素，综合采取协商分期、资产处置、债务重组或法律程序等措施处理。

2. 具体分析：

   • 若债务为同一银行或关联方：
     若50万债务均属于同一家银行（或两家银行为同一控股方），可优先与银行协商分期还款计划或延长还款期限。根据《商业银行信用卡业务监督管理办法》第70条（若为信用卡债务）或《民法典》第678条（借款合同可变更还款期限），银行在债务人暂时无力偿还时，应同意分期或展期。需提供收入证明、资产清单等材料证明偿债意愿及能力。

   • 若债务为不同银行且无关联：
     需分别与两家银行协商，优先处理利息较高或催收压力较大的债务。若两家银行均拒绝协商，可考虑资产变现偿债（如出售房产、车辆等），或通过债务重组（如引入第三方担保、以物抵债等）降低还款压力。若资产不足以覆盖全部债务，可依据《民法典》第1187条（遗产清偿债务规则的类推适用）或《企业破产法》（若为个体工商户）申请个人债务清理程序（部分地区试点中）。

   • 若涉及担保或共同债务：
     若债务有担保人，银行可要求担保人承担还款责任；若为夫妻共同债务，需根据《民法典》第1064条判断是否属于共同签字或用于家庭共同生活，否则可能仅由借款人承担。此时可与银行协商剥离非必要债务人的责任。

3. 风险提示：

   • 避免“以贷养贷”或虚假陈述资产状况，否则可能构成信用卡诈骗罪（《刑法》第196条）或贷款诈骗罪（《刑法》第193条）。
     
   • 若银行起诉，法院可能查封、拍卖债务人名下资产（如农村宅基地上的房屋可能因政策限制难以拍卖，但土地使用权可能被收回）。
     
   • 长期逾期会导致征信记录恶化，影响未来贷款、就业甚至子女入学（部分私立学校会审查父母征信）。

4. 行动建议：

   • 立即整理所有债务合同、还款记录及资产证明，计算实际负债率（债务/资产）。
     
   • 优先与利息较高的银行协商，尝试争取“停息挂账”或减免部分罚息。
     
   • 若协商无果，可向当地银保监会或金融调解组织申请调解，或通过“中国审判流程信息公开网”查询类似案例判决结果，评估诉讼风险。
     

如有进一步细节（如债务类型、是否有担保、资产状况等），可提供具体信息以便针对性分析。