结论：公司安排员工每天上班12小时是否违反劳动法，需根据具体情况判断。在一般情况下，未经合法审批且未支付相应加班费的12小时工作制是违反劳动法的；但在特殊工时制下或特定紧急情况下，可能存在合法性的例外。以下从多个角度进行详细分析：
一、法律规定层面
根据《中华人民共和国劳动法》第三十六条的规定，国家实行劳动者每日工作时间不超过八小时、平均每周工作时间不超过四十四小时的工时制度。这一规定明确了标准工时的上限，旨在保护劳动者的休息权益。同时，《劳动法》第四十一条进一步指出，用人单位由于生产经营需要，经与工会和劳动者协商后可以延长工作时间，但一般每日不得超过一小时；因特殊原因需要延长工作时间的，在保障劳动者身体健康的条件下延长工作时间每日不得超过三小时，但是每月不得超过三十六小时。
因此，从法律条文来看，未经法定程序批准或超出法定时长的12小时工作制，直接违反了劳动法的强制性规定。
二、特殊情况下的合法性边界
尽管存在上述限制，但在特定情形下可能允许延长工作时间：
不定时工作制：
- 适用于因工作性质、特点或职责限制无法按标准工作时间衡量的职工，如高级管理人员、外勤人员等。
- 用人单位应采用集中工作、集中休息、轮休调休等方式确保职工休息休假权利。
- 在此制度下，上班12小时不一定违法，但需确保职工整体工作时间和休息权益得到保障，且需经过劳动行政部门的审批。
综合计算工时工作制：
- 以周、月、季、年为周期综合计算工作时间，但平均日工作时间和周工作时间应与法定标准基本相同。
- 适用于交通、铁路、邮电等特殊行业需连续作业的职工。
- 在综合计算周期内，某一日（或周）实际工作时间可超过8小时（或40小时），但总实际工作时间不应超过总法定标准工作时间。超过部分需按加班处理并支付加班工资。因此，在这种情况下，12小时工作制不一定违反劳动法，但需确保综合计算周期内总工时不超法定标准，并依法支付加班费。
依法延长工作时间：
- 根据《劳动法》第四十二条的规定，在发生自然灾害、事故或者因其他原因威胁劳动者生命健康和财产安全需要紧急处理，以及生产设备、交通运输线路、公共设施发生故障影响生产和公众利益必须及时抢修等情形下，延长工作时间可以不受一般加班限制的约束。
- 在这些情况下，如果用人单位与工会和劳动者协商一致，或符合法律规定的特殊情形，并依法支付加班工资，则安排劳动者上班12小时是合法的。
三、劳动者权益保护及维权途径
- 拒绝违法加班：如果用人单位违反规定强制劳动者加班，劳动者有权拒绝。
- 投诉与仲裁：若用人单位安排加班不支付加班费，劳动者可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁以维护自身合法权益。在投诉或仲裁时，劳动者应保存好考勤记录、工资条、加班通知等书面材料作为证据。
- 协商与调解：在内部协商阶段，劳动者可以优先向人力资源部门反映问题，要求调整工作时间或支付加班费。如果协商无果，再考虑通过法律途径解决。
总结：公司安排员工每天上班12小时是否违反劳动法，需综合考虑工时制度、加班审批、加班费支付以及劳动者休息休假权利等多个方面。在任何情况下，用人单位都应严格遵守劳动法的规定，确保劳动者的合法权益得到保障。对于特殊行业或情况下的工作时间安排，需经过合法审批并采取相应的保障措施。如果您对此有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。