结论：公司把一部分工资发到微信，一部分发到银行卡，这种做法是否合法，主要取决于是否依法履行了工资支付的相关义务，包括是否与员工协商一致、是否依法代扣代缴个人所得税、是否确保工资支付的透明度和可追溯性等。

详细分析：

1. 协商一致原则：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，用人单位与劳动者应当遵循平等自愿、协商一致的原则确定工资支付方式和时间。如果公司在发放工资前，已经与员工进行了充分的沟通，并得到了员工的明确同意，将一部分工资通过微信支付，另一部分通过银行卡支付，这种做法在协商一致的前提下是合法的。

2. 依法代扣代缴个人所得税：

   • 无论工资通过何种方式支付，公司都有义务依法代扣代缴员工的个人所得税。如果公司能够确保通过微信和银行卡支付的工资总额准确无误，并依法进行了个人所得税的代扣代缴，那么这种支付方式在税务方面也是合法的。

3. 工资支付的透明度和可追溯性：

   • 工资支付应当具有透明度和可追溯性，以便员工能够清晰地了解自己的工资构成和支付情况。如果公司能够提供详细的工资支付记录，包括微信和银行卡的支付明细，并确保这些记录真实、准确、完整，那么这种支付方式在透明度方面也是符合要求的。

4. 潜在风险与注意事项：

   • 尽管在协商一致、依法代扣代缴个人所得税和确保透明度的情况下，公司可以通过微信和银行卡分别支付工资，但这种做法也存在一定的潜在风险。例如，微信支付可能缺乏正式的财务凭证，不利于员工在需要时提供证明；同时，如果公司未能妥善保管微信支付记录，可能导致工资支付情况无法追溯。
   • 因此，建议公司在采用这种支付方式时，务必与员工签订书面协议，明确工资支付的方式、时间、金额等关键信息，并妥善保管相关的支付记录和凭证。

建议：

• 如果您作为员工，对公司通过微信和银行卡分别支付工资的做法存在疑虑或担忧，建议您与公司进行沟通，要求公司提供详细的工资支付记录和凭证，并确保这种支付方式符合相关法律法规的要求。
• 如果您作为公司方，打算采用这种支付方式，建议您事先与员工进行充分的沟通，并签订书面协议以明确双方的权利和义务。同时，务必确保依法代扣代缴个人所得税，并妥善保管相关的支付记录和凭证。

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