关于“不起诉保证金是否退还”的问题，结论需要分情况讨论，具体如下：
如果案件最终不起诉，保证金通常应当退还：
- 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，取保候审的保证金是为了保证犯罪嫌疑人、被告人不逃避或妨碍侦查、起诉和审判，并按时到案接受处理而缴纳的。如果案件最终决定不起诉，意味着犯罪嫌疑人、被告人没有被追究刑事责任，那么保证金的目的已经达成，应当予以退还。
- 退还保证金的具体程序一般是由犯罪嫌疑人、被告人或其法定代理人、近亲属等向作出取保候审决定的机关提出申请，机关在审查后确认符合退还条件的，会及时退还保证金。
如果存在违反取保候审规定的情况，保证金可能不予退还：
- 如果在取保候审期间，犯罪嫌疑人、被告人违反了相关规定，如未经批准离开居住地、干扰证人作证、毁灭证据等，那么根据法律规定，保证金可能不予退还，或者部分不予退还。
- 这种情况下，不予退还的保证金将上缴国库，作为对违反规定行为的处罚。
关于保证金退还的实践操作：
- 在实际操作中，保证金退还的流程可能因地区和具体案件情况而有所不同。一般来说，需要提交退还保证金的申请书，并提供相关证明材料，如取保候审决定书、保证金收据等。
- 机关在收到申请后，会进行审查，并可能要求申请人补充材料或进行询问。审查通过后，机关会出具退还保证金的决定书，并通知申请人领取保证金。
法律建议：
- 如果您或您的亲友涉及此类情况，建议首先了解案件的具体进展和决定结果。如果案件已经决定不起诉，且没有违反取保候审规定的情况，那么可以及时向作出取保候审决定的机关提出退还保证金的申请。
- 在申请过程中，务必提供完整的证明材料和准确的联系方式，以便机关能够及时与您联系并处理申请。
- 如果遇到机关拒绝退还保证金或拖延退还的情况，您可以依法向上一级机关申诉或寻求法律援助，维护自己的合法权益。
可能遇到的法律后果：
- 如果违反取保候审规定导致保证金不予退还，除了经济损失外，还可能面临更严格的监管措施或被重新采取强制措施的风险。
- 如果机关在退还保证金过程中存在违法行为或不当行为，您可以通过法律途径追究其责任并寻求赔偿。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。