结论前置：公司扣除企业年金但未发放给员工，这一行为是否违法需分情况讨论，具体如下：

1. 若企业年金属于法定福利且公司未按规定缴纳：

   • 法律背景：企业年金并非法定必须缴纳的福利，它是在基本养老保险基础上，企业根据自身经济实力和经济状况建立的，旨在为本企业职工提供一定程度退休收入保障的补充性养老金制度。但如果公司承诺了缴纳企业年金，或者劳动合同、集体合同中有相关约定，那么公司就有义务按照约定缴纳。
   • 法律建议：若公司扣除企业年金后未按规定缴纳至员工个人账户，也未用于其他合法用途（如集体福利等，但这种情况较为罕见且需员工同意），而是私自截留或挪用，这可能构成违法行为。员工有权要求公司补缴企业年金，并可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。

2. 若企业年金属于公司自愿福利且未明确约定发放方式：

   • 法律背景：如果企业年金是公司自愿提供的福利，且劳动合同、员工手册或相关规章制度中未明确约定企业年金的缴纳、发放方式及条件，那么公司扣除企业年金后未发放给员工的行为，可能不直接构成违法，但可能违反公司内部的规章制度或承诺。
   • 法律建议：员工应首先查阅劳动合同、员工手册或相关规章制度，了解企业年金的具体约定。如果公司行为违反了这些约定，员工可以与公司协商解决，要求公司按照约定发放企业年金。如果协商无果，员工也可以考虑通过法律途径维护自己的权益，如向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，但需注意收集相关证据以支持自己的主张。

3. 若公司扣除企业年金用于其他合法用途且已告知员工：

   • 法律背景：在某些特殊情况下，公司可能因经营困难或其他原因，需要暂时扣除企业年金用于其他合法用途（如支付员工工资、缴纳社保等），且已提前告知员工并取得员工同意。
   • 法律建议：在这种情况下，公司扣除企业年金的行为可能不构成违法，但需确保扣除的用途合法、合理，且已取得员工的明确同意。员工应关注公司扣除企业年金的具体用途和期限，确保自己的权益不受损害。如果公司未按照约定用途使用企业年金或未按时归还，员工有权要求公司承担相应的法律责任。

进一步思考：在处理此类问题时，员工应首先了解自己的权益和公司的义务，查阅相关法律法规和公司内部规章制度。如果公司行为涉嫌违法或违反约定，员工应积极与公司沟通协商，要求公司纠正错误行为并承担相应的法律责任。如果协商无果，员工可以考虑通过法律途径维护自己的权益。同时，员工也应注意保留相关证据，如工资条、劳动合同、员工手册等，以便在需要时提供证明。

最后，如果你在处理此类问题时遇到任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。