公司要求在申请延长医疗期时做劳动能力鉴定的目的主要有以下两点：

1. 确定员工劳动能力受损程度，评估是否符合延长医疗期的条件
   根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，医疗期的延长需基于员工实际病情对劳动能力的影响。劳动能力鉴定能通过医学检查明确员工当前劳动功能障碍程度（如完全丧失、大部分丧失或部分丧失劳动能力），为判断是否需要延长医疗期提供客观依据。例如，若鉴定结果显示员工因疾病导致完全丧失劳动能力，公司可能需依法批准延长医疗期；若仅部分丧失，则可能结合岗位需求决定是否延长。

2. 为公司后续用工管理提供依据，降低法律风险
   劳动能力鉴定结果直接影响公司对员工岗位调整、工资支付、合同解除等决策的合法性。例如：

   • 若鉴定为完全丧失劳动能力，公司需按《工伤保险条例》或《劳动合同法》处理劳动关系（如支付伤残补助、协商解除合同等），避免因未依法处理被认定为违法解除；
     
   • 若鉴定为部分丧失劳动能力，公司可与员工协商调岗或调整工作内容，确保用工合规性。
     通过鉴定，公司能提前规划用工策略，减少因医疗期延长引发的劳动争议。

总结：公司要求劳动能力鉴定的核心目的是通过医学评估确认员工病情对劳动能力的影响，既保障员工合法权益，也为公司依法管理劳动关系提供依据。若对鉴定流程或结果有疑问，可直接向我咨询具体操作细节。