核心结论：公司和客户签署协议时，若甲方写为员工个人而非公司，这可能会引发一系列法律问题，包括合同效力、责任承担等。具体处理方式需根据实际情况来判断，以下从几个角度进行分析。

1. 合同效力问题：

   • 一般情况：合同是双方真实意思表示的产物，若员工未经公司授权或超越权限以公司名义签署合同，且客户对此不知情，该合同可能因无权代理或表见代理而对公司产生效力（若构成表见代理）或无效（若无权代理且客户知情）。但在此情况下，若甲方直接写为员工个人，则合同主体为员工，与公司无直接关联，除非公司事后追认。
   • 特殊情况：若员工是公司的法定代表人或持有公司有效授权委托书，且以公司名义签署合同，即便甲方处写为员工名字（实际操作中应避免，以明确合同主体），但合同实质上仍代表公司，合同效力及于公司。不过，这种操作方式极易引发纠纷，不建议采用。

2. 责任承担问题：

   • 员工个人责任：若合同甲方为员工个人，且合同内容未涉及公司业务或未经公司同意，那么员工个人需承担合同约定的权利义务，包括可能的违约责任。
   • 公司连带责任：在特定情况下，如员工行为构成职务行为或表见代理，公司可能需要承担连带责任。但这通常取决于客户是否善意且无过失地相信员工有代理权，以及公司是否存在过错（如管理不善导致员工滥用职权）。

3. 建议处理方式：

   • 立即更正：若发现协议甲方错误地写为员工个人，应立即与客户沟通，更正合同主体为公司，并重新签署协议。
   • 补充协议：若已签署且难以更正，可考虑与客户签署补充协议，明确合同实际主体为公司，员工仅为签署人，合同权利义务由公司承担。
   • 内部管理：加强公司内部管理，明确员工对外签署合同的权限和流程，避免类似情况再次发生。

4. 法律后果预估：

   • 若未及时处理：可能导致公司无法享受合同权利，或需承担不必要的合同义务，甚至可能因员工个人行为而卷入法律纠纷。
   • 若积极处理：通过更正合同或签署补充协议，可以明确合同主体，保护公司合法权益，避免潜在的法律风险。

进一步思考：在签署任何合同前，都应仔细审查合同主体、内容、条款等，确保合同符合法律法规要求，且能够准确反映双方的真实意思表示。若对合同签署流程或内容存在疑问，建议及时咨询专业律师，以降低法律风险。如有任何公司法务方面的疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。