签字按手印并加盖公章的协议，在符合法定条件的情况下，是具有法律效力的。以下从多个角度为您详细分析：
一、法律效力基础
《中华人民共和国民法典》的相关规定：
- 根据《民法典》第四百九十条，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。这意味着，签字、按手印和盖章都是合同成立的有效方式，具有同等的法律效力。
签字、按手印和盖章的法律意义：
- 签字：是当事人对合同内容认可并愿意受其约束的直接表达。
- 按手印：在法律上被视为一种特殊的签名方式，能够证明当事人的身份和意愿，尤其在当事人不会写字或无法签字时，按手印可以作为一种有效的替代方式。
- 盖章：对于单位或组织而言，盖章是确认合同效力的重要方式，能够证明合同是单位或组织的真实意思表示。
二、协议具有法律效力的条件
行为人具有相应的民事行为能力：
- 签订协议的各方当事人必须具备完全民事行为能力，能够独立进行民事活动并承担民事责任。未成年人、精神病人等不具备完全民事行为能力的人签订的协议，其效力可能存在问题。
意思表示真实：
- 协议内容必须是当事人真实意愿的体现，不存在欺诈、胁迫、重大误解等情形。如果一方通过不正当手段迫使对方签订协议，该协议可能被撤销或认定无效。
内容合法且不违背公序良俗：
- 协议的条款不能违反国家法律法规的强制性规定，也不得损害社会公共利益、违背社会公德或他人的合法权益。例如，以违法犯罪为内容的协议，或明显不公平、损害弱势群体利益且违背道德伦理的协议，均不具有法律效力。
形式符合法律规定：
- 虽然签字按手印并加盖公章是常见的确认方式，但法律可能要求某些协议必须以书面形式签订，或者必须经过公证、鉴证等特定程序才能生效。如果法律或行政法规有此类规定，或者当事人之间有此约定，则必须遵守。
三、特殊情况说明
协议存在瑕疵或争议时的处理：
- 如果协议存在笔误、歧义或其他可能导致误解的情况，双方应协商解决；协商不成的，可寻求法律途径解决。
- 若一方主张协议无效或可撤销，需提供充分证据证明存在法定无效或可撤销的情形（如欺诈、胁迫等）。
与其他证据的结合使用：
- 签字按手印并加盖公章的协议是证明双方权利义务关系的重要证据，但并非唯一证据。法院在审理案件时，会结合其他相关证据（如履行情况、交易习惯等）进行综合判断。
四、实际建议
确保协议内容合法合规：
- 在签订协议前，务必仔细阅读协议条款，确保内容符合法律法规的规定，不违背公序良俗。
明确各方权利义务：
- 协议中应明确约定各方的权利义务，避免出现模糊不清或容易产生歧义的条款。
保留相关证据：
- 在签订和履行协议过程中，注意保留相关证据，如转账记录、聊天记录等，以备不时之需。
及时咨询专业律师：
- 如果对协议的法律效力或条款内容存在疑问，建议及时咨询专业律师，以确保自己的合法权益得到保障。
总之，签字按手印并加盖公章的协议在符合法定条件的情况下是具有法律效力的。但为了确保协议的合法有效性和避免潜在纠纷，建议您在签订前仔细阅读协议条款，并在必要时咨询我的意见。如果您有任何法律问题或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。