支付违约金但不开发票的行为，税务机关有权进行处罚。以下从不同角度进行分析：

1. 税务合规角度
   根据《中华人民共和国发票管理办法》第十九条，销售商品、提供服务以及从事其他经营活动的单位和个人，对外发生经营业务收取款项，收款方应当向付款方开具发票。违约金属于因合同违约产生的经济补偿，若收款方收取违约金后未开具发票，属于未按规定开具发票的违法行为。税务机关可依据《发票管理办法》第三十五条，责令改正并处以1万元以下罚款；情节严重的，可处1万元以上3万元以下罚款。

2. 合同履行与税务关联性
   若违约金与合同履行直接相关（如因延迟交货产生的赔偿），其性质属于合同价款的一部分，收款方必须开具发票。即使合同未明确约定发票开具条款，根据《增值税暂行条例》第六条，销售额为纳税人销售货物或应税劳务向购买方收取的全部价款和价外费用，违约金属于价外费用，应纳入增值税计税依据并开具发票。

3. 例外情形
   若违约金属于非经营性赔偿（如因个人侵权产生的赔偿），且收款方未发生增值税应税行为，则无需开具发票。但此类情形需严格区分性质，例如：

   • 合同未履行前因单方违约解除合同产生的赔偿，若未实际发生货物或服务交易，可能不涉及增值税；
     
   • 但若合同已部分履行，违约金与已履行部分相关，则仍需开具发票。

4. 法律后果
   除行政处罚外，若付款方因未取得发票而无法税前扣除，可能引发民事纠纷。根据《企业所得税税前扣除凭证管理办法》，企业取得不合规发票不得作为税前扣除凭证，付款方有权要求收款方重新开具发票或承担相应损失。

建议：

• 收款方应严格区分违约金性质，对经营性违约金及时开具发票；
  
• 付款方若未取得发票，可向税务机关举报或通过民事诉讼主张权利；
  
• 双方可在合同中明确约定违约金发票开具条款，避免争议。
  

如有具体案件细节，可进一步提供信息以便针对性分析。