当检察院作出不起诉决定后，对于被不起诉人所在单位而言，处理流程主要围绕接收不起诉决定书、理解决定内容、以及根据具体情况采取相应措施展开。以下是对这一流程的详细解析：
一、接收不起诉决定书
检察院在作出不起诉决定后，会制作正式的不起诉决定书，并送达被不起诉人及其所在单位。这是单位了解案件处理结果的第一步，也是后续处理的基础。
二、理解不起诉决定内容
单位在收到不起诉决定书后，应仔细阅读并理解其内容。不起诉决定书会明确阐述不起诉的理由和法律依据，单位需要根据这些信息来判断案件的性质和后续可能的影响。
法定不起诉：如果是因为犯罪嫌疑人没有犯罪事实，或者符合《刑事诉讼法》第十六条规定的情形（如情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的；犯罪已过追诉时效期限的等）而作出的不起诉决定，单位可以认为被不起诉人在法律上被视为无罪，无需进一步处理。
酌定不起诉：对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的，检察院可以作出不起诉决定。在这种情况下，单位可能需要考虑对被不起诉人进行内部处理，如训诫、责令具结悔过、赔礼道歉或赔偿损失等，具体取决于单位的规定和案件的具体情况。
存疑不起诉：如果经过补充侦查后，检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，会作出不起诉决定。在这种情况下，单位应关注案件是否有新证据出现的可能性，以及是否需要配合公安机关或检察院进行进一步的调查。
三、根据具体情况采取相应措施
内部处理：根据不起诉决定的类型和单位的规定，单位可能需要对被不起诉人进行内部处理。这可能包括调整工作岗位、进行纪律处分、要求赔偿损失等。在处理过程中，单位应确保程序的公正性和合法性，尊重被不起诉人的合法权益。
配合司法程序：如果被害人或公安机关对不起诉决定不服，可能会提出申诉或要求复议复核。在这种情况下，单位应配合司法程序，提供必要的协助和证据材料。
关注后续影响：不起诉决定可能会对被不起诉人的职业发展和单位声誉产生一定影响。单位应关注这些后续影响，并采取必要的措施来减轻或消除不良影响。例如，可以为被不起诉人提供职业培训和心理辅导，帮助其重新融入社会；同时，也可以加强单位内部的合规管理，防止类似事件再次发生。
四、特殊情形处理
附条件不起诉：如果涉及未成年人且符合附条件不起诉的条件，单位应关注考验期的设置和监督考察规定。在考验期内，单位应配合检察机关对被不起诉人进行监督考察，确保其遵守规定并表现出悔罪态度。
特别不起诉：在涉案企业通过建立合规管理体系整改有效的情况下，可能会适用特别不起诉程序。单位应了解这一程序的适用条件和程序要求，并积极配合检察机关进行合规整改和验收工作。
综上所述，检察院作出不起诉决定后，单位应根据不起诉决定的类型和单位的规定采取相应措施。在处理过程中，单位应确保程序的公正性和合法性，尊重被不起诉人的合法权益，并关注案件的后续影响。