迟到1小时扣除半日工资是否合法，需结合公司规章制度、劳动者行为及法律规定综合判断，若公司无明确合法规章制度支持或扣罚过重，则此行为可能不合法。以下从不同角度为您详细分析：
一、公司规章制度的合法性
规章制度需合法制定：
- 公司必须有明确、合理且合法的规章制度，该制度需经过民主程序制定（如职工代表大会讨论、与工会协商等），并向员工公示或告知。
- 若规章制度中规定了迟到扣半天工资的内容，并且符合上述条件，则公司有权依此执行。但即便如此，扣罚的合理性仍需进一步考量。
规章制度内容需合理：
- 规章制度中的扣罚条款应适度，不能过分损害劳动者的权益。迟到1小时扣除半日工资，在多数情况下可能因处罚过重而被认定为不合理。
二、迟到行为的性质与后果
未造成经济损失的情况：
- 若员工迟到未给公司造成直接经济损失，公司以迟到为由扣半天工资通常缺乏法律依据。此时，公司应通过其他方式管理，如批评教育、警告等，而非直接扣罚工资。
造成经济损失的情况：
- 若员工迟到确实给公司造成了经济损失，公司扣工资也需遵循法定程序和标准。根据《工资支付暂行规定》第十六条，扣除部分不得超过当月工资的20%，且剩余工资不得低于当地最低工资标准。
三、扣罚的合理性分析
- 惩罚与行为不对等：迟到1小时只是短暂影响工作时间，而扣除半日工资则意味着劳动者半天的劳动未获得报酬，这在惩罚力度上显然不成比例，违背了公平合理原则。
- 比例原则：在法律上，处罚应与违法行为造成的后果相适应。迟到1小时与扣除半日工资之间，显然缺乏合理的比例关系。
四、劳动者的权益保护
协商解决：
- 若劳动者认为公司扣工资行为不合理，可首先与公司协商解决。在协商过程中，劳动者可以提出自己的异议和理由，要求公司重新考虑扣罚决定。
投诉与仲裁：
- 协商不成时，劳动者可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。在投诉或仲裁过程中，劳动者需要提供相关证据（如劳动合同、规章制度、工资单、考勤记录等）来支持自己的主张。
法律途径：
- 在极端情况下，如公司拒不改正其违法行为，劳动者甚至可以通过法律途径提起诉讼，要求公司承担相应的法律责任。
五、具体建议
- 保留证据：无论采取哪种维权方式，劳动者都应保留好相关证据，以便在需要时提供证明。
- 及时咨询：若对公司的扣罚行为有疑问或不满，劳动者应及时咨询专业律师或相关机构，以获取更具体的法律建议和帮助。
总结来说，迟到1小时扣除半日工资是否合法，取决于公司是否有合法有效的规章制度支持、迟到行为的性质与后果以及扣罚的合理性。公司应确保规章制度的合法性与合理性，而劳动者在遇到不合理扣工资行为时也应积极维护自己的权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。