若法院执行时发现对方将钱入股，可采取以下措施来维护自身合法权益：
申请法院采取强制执行措施
- 股权查封与冻结：根据《中华人民共和国民事诉讼法》及相关司法解释，法院有权对被执行人的财产采取查封、扣押、冻结等强制措施。若对方将资金入股至某公司，可向法院申请查封、冻结其持有的该公司股权。这需要提供对方入股的具体信息，如公司名称、股权比例、入股时间等，以便法院精准执行。
- 股权评估与拍卖：在股权被查封、冻结后，法院可委托专业评估机构对股权价值进行评估，并依据评估结果进行拍卖或变卖。拍卖所得款项将用于偿还你的债务。若对方持有的是有限责任公司股权，还需注意《公司法》中关于股权转让的限制性规定，确保拍卖程序合法合规。
追究对方转移财产的法律责任
- 撤销权行使：若对方在明知存在债务纠纷的情况下，仍故意将资金入股以逃避执行，可能构成恶意转移财产。根据《中华人民共和国民法典》第五百三十八条，你可向法院提起撤销权之诉，请求撤销对方的入股行为，并恢复原状，即将入股资金返还至对方名下，以便法院执行。
- 拒不执行判决、裁定罪：若对方的行为情节严重，如通过虚假入股、伪造证据等手段抗拒执行，可能触犯《中华人民共和国刑法》第三百一十三条规定的拒不执行判决、裁定罪。你可向公安机关报案，要求追究对方的刑事责任，以形成对对方的有效震慑。
其他辅助措施
- 申请限制高消费与纳入失信被执行人名单：向法院申请对对方采取限制高消费措施，如限制乘坐飞机、高铁等交通工具，限制在星级酒店消费等。同时，申请将对方纳入失信被执行人名单，对其社会信用进行惩戒，增加其违法成本。
- 持续关注对方财产动态：在执行过程中，持续关注对方的财产状况，包括但不限于银行账户、房产、车辆、股权等。一旦发现对方有新的财产线索，立即向法院报告，以便法院及时采取执行措施。
行动建议：
- 收集证据：收集对方入股的相关证据，如入股协议、转账记录、公司章程等，以证明对方存在转移财产的行为。
- 及时沟通：与执行法院保持密切沟通，及时了解执行进展，提供必要的协助与配合。
- 法律咨询：在执行过程中遇到复杂问题或不确定情况时，及时向我咨询，以便获得更专业、更具体的法律建议。