是否需要签订土地补充协议，需根据厂房所在土地的权属及使用情况综合判断，具体分为以下两种情形：

1. 若厂房所在土地已取得合法土地使用权证（如国有土地使用权证或集体建设用地使用权证），且土地用途、使用年限等核心条款与厂房建设需求一致
   此时通常无需签订土地补充协议。办理房产证的核心材料是《国有土地使用证》或《集体建设用地使用证》原件，以及规划、施工、验收等证明文件。但需注意：若原土地出让合同或划拨决定书中对建筑规模、容积率等有特殊限制，而厂房实际建设超出约定范围，则需先通过规划变更、补缴土地出让金等方式完善手续，否则可能影响房产证办理。

2. 若厂房所在土地存在权属瑕疵或使用条件变更（如土地用途从工业用地变更为其他用途、土地使用权人变更、原土地合同到期续期等）
   此时必须签订土地补充协议。例如：

   • 土地使用权人发生变更（如企业改制、股权转让导致权属转移），需新老权利人签订补充协议明确权属；
     
   • 原土地出让合同约定“自持不得转让”，但现需分割转让给第三方，需与自然资源部门签订补充协议调整条款；
     
   • 土地使用年限即将到期需续期，需签订补充协议重新约定使用年限及土地价款。
     补充协议需经自然资源部门备案或审批，否则可能被认定为无效，直接影响房产证办理。

实务建议：

• 办理前务必核查土地权属证书及出让合同/划拨决定书，重点确认土地用途、使用年限、建筑密度等条款是否与厂房现状一致；
  
• 若涉及土地条件变更，建议提前与当地自然资源部门沟通，明确是否需要签订补充协议及具体流程；
  
• 补充协议内容需明确约定土地价款、支付方式、违约责任等核心条款，避免因条款模糊导致后续纠纷。
  

如有具体案例或合同文本需要分析，可直接向我提供详细信息，我会进一步结合地方政策为您解读。