结论：公司因员工骑电车不戴头盔而扣钱的行为，其合法性取决于当地是否有相关法规要求骑电动车必须佩戴头盔，以及公司扣钱的依据和程序是否合法。在多数情况下，公司直接扣钱可能缺乏明确的法律依据，因此可能不合法。
详细分析：
地方性法规的考量：
- 在许多城市和地区，通过地方性法规或规章明确规定了电动自行车驾乘人员必须佩戴安全头盔。这些规定的立法目的主要是为了保障电动车驾乘人员的交通安全。
- 如果当地有此类规定，并且明确规定了未佩戴头盔的处罚措施，那么员工未佩戴头盔可能面临交通管理部门的罚款，但这并不直接赋予公司扣钱的权利。
公司规章制度的合法性：
- 公司若要在内部对员工进行罚款或扣钱，必须基于合法、合理的规章制度，并且这些规章制度需要经过民主程序制定，且不得违反法律法规的强制性规定。
- 如果公司规章制度中明确规定了骑电动车不戴头盔将扣钱，并且这一规定不违反当地法律法规，同时员工在入职时已经知晓并同意这一规定，那么公司扣钱的行为在内部管理上可能是合法的。但这种合法性并不等同于法律上的罚款权，公司无权对员工进行法律意义上的罚款，只能依据规章制度进行内部管理处罚，如扣减奖金、绩效等（且需符合劳动合同及内部规章制度的规定）。
法律程序的遵循：
- 无论公司基于何种理由扣钱，都必须遵循合法的程序，如事先告知员工、听取员工的陈述和申辩等。
- 如果公司未遵循合法程序，或者扣钱的依据不明确、不合理，那么员工有权对公司的扣钱行为提出异议，并可以通过法律途径维护自己的合法权益。
安全建议与权益保护：
- 从安全角度出发，无论法律是否有强制要求，佩戴头盔都是非常有必要的。它能在很大程度上减少头部受伤的风险，保护骑行者的生命安全。
- 如果员工认为公司的扣钱行为不合法或存在争议，可以与公司进行沟通协商，或者向劳动监察部门投诉举报，甚至通过劳动仲裁或诉讼等途径来维护自己的合法权益。
举例说明：
假设某公司规章制度中规定：“员工骑电动车上下班必须佩戴头盔，否则每次扣减奖金50元。”如果这一规定已经过民主程序制定，且不违反当地法律法规，同时员工在入职时已经知晓并同意这一规定，那么当员工未佩戴头盔时，公司按照规章制度扣减奖金的行为在内部管理上可能是合法的。但是，如果公司直接扣减员工的工资，而非奖金或绩效，且没有明确的规章制度依据，那么这种行为就可能不合法。
总结与建议：
公司因员工骑电车不戴头盔而扣钱的行为，其合法性需要综合考虑地方性法规、公司规章制度以及法律程序的遵循情况。在多数情况下，公司直接扣钱可能缺乏明确的法律依据，因此可能不合法。为了保障自身权益和安全考虑，建议员工自觉遵守相关法律法规要求佩戴头盔的规定，并在遇到争议时依法维护自己的合法权益。同时，公司也应制定合法、合理的规章制度，并遵循合法程序进行内部管理。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。