结论：是否违法需结合具体情况判断，若营业执照属于公司财产，股东或实际控制人擅自拿走可能涉嫌违法；若属于个人财产，则一般不违法。以下从不同角度详细分析：
一、营业执照的财产属性
公司财产：
- 若足疗店的营业执照是以公司名义申请并获得的，那么该营业执照属于公司的财产。
- 根据《中华人民共和国公司法》的相关规定，公司财产受法律保护，任何单位和个人不得侵犯。
- 在这种情况下，如果股东或实际控制人擅自拿走营业执照，可能构成对公司财产的侵占或损害，涉嫌违法。
个人财产：
- 若足疗店是个体工商户，且营业执照是以个人名义申请并获得的，那么该营业执照属于个人财产。
- 在这种情况下，营业执照的持有人有权自由处置其财产，包括拿走营业执照，一般不构成违法。
二、擅自拿走营业执照的可能后果
对公司运营的影响：
- 营业执照是公司合法经营的凭证，擅自拿走可能导致公司无法正常进行经营活动，如无法签订合同、无法开具发票等。
- 这可能给公司带来经济损失，并影响公司的信誉和形象。
法律责任：
- 如果擅自拿走营业执照的行为构成对公司财产的侵占或损害，公司有权要求行为人返还营业执照，并可能追究其法律责任。
- 根据具体情况，行为人可能面临民事赔偿、行政处罚甚至刑事责任。
三、建议与措施
沟通协商：
- 如果发生营业执照被擅自拿走的情况，首先建议与行为人进行沟通协商，了解其行为动机和目的。
- 尝试通过友好方式解决问题，避免矛盾升级和法律纠纷。
法律途径：
- 如果沟通协商无果，公司可以考虑通过法律途径解决问题。
- 可以向法院提起诉讼，要求行为人返还营业执照，并赔偿因此造成的损失。
- 如果行为人的行为涉嫌犯罪，还可以向公安机关报案，追究其刑事责任。
预防措施：
- 为避免类似情况的发生，公司应加强对营业执照等重要证件的管理和保管。
- 可以制定相关规章制度，明确营业执照的保管责任和使用程序。
- 定期对营业执照等证件进行盘点和检查，确保其安全无损。
总结与启示：擅自拿走营业执照是否违法需结合具体情况判断。如果是公司财产，则可能涉嫌违法；如果是个人财产，则一般不违法。但无论何种情况，擅自拿走营业执照都可能对公司运营造成不良影响。因此，建议加强管理和保管重要证件，避免类似情况的发生。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。