结论：与正在服用精神分裂症药物的配偶协议离婚是否合法，需根据配偶的具体民事行为能力状况来判断。若配偶在签署离婚协议时具备完全民事行为能力，则协议离婚合法；若配偶属于无民事行为能力人或限制民事行为能力人，则无法通过协议方式离婚，而需通过诉讼程序解决。
一、协议离婚的合法性条件
根据《中华人民共和国民法典》第一千零七十六条，夫妻双方自愿离婚的，应当签订书面离婚协议，并亲自到婚姻登记机关申请离婚登记。这一条款强调了协议离婚要求夫妻双方均具有完全民事行为能力，能够真实、自主地表达自己的意愿。
完全民事行为能力：
- 若配偶在服用精神分裂症药物期间，病情稳定，具备完全民事行为能力，能够理解离婚的含义、后果及法律程序，那么双方可以协商并签订离婚协议，实现协议离婚。
无或限制民事行为能力：
- 若配偶因精神分裂症病情严重，无法辨认或不能完全辨认自己的行为，属于无民事行为能力人或限制民事行为能力人，则无法准确表达真实意愿，不具备协议离婚的主体条件。
二、诉讼离婚的必要性
当配偶属于无民事行为能力人或限制民事行为能力人时，无法通过协议方式离婚，另一方需向法院提起离婚诉讼。
法定代理人参与：
- 在诉讼中，法院会指定配偶的法定代理人（如父母、成年子女等）代为参与诉讼，以保障配偶的合法权益。法定代理人将代为表达配偶的意愿，参与离婚协议的协商或法院的审理。
法院综合判断：
- 法院将综合考虑配偶的精神状况、婚姻关系的实际情况以及双方的权益，作出公正的判决。判决可能涉及离婚、子女抚养、财产分割等问题。
三、实际操作建议
专业评估：
- 建议由精神科医师对配偶的行为能力进行评估，确保其在签署协议或参与诉讼时具备相应认知能力。这有助于确定配偶是否具备协议离婚的主体条件。
法律协助：
- 在处理涉及精神病人的离婚案件时，应寻求专业律师的帮助。律师可以协助起草离婚协议，明确约定监护权归属、医疗费用分担等特殊条款；也可以在诉讼中提供法律支持，确保法律程序的顺利进行。
保护权益：
- 在整个过程中，应特别注重保护精神病人的合法权益，确保其不会因离婚而遭受不公。例如，在财产分割上应公平合理，在子女抚养安排上需符合未成年人最佳利益原则。
四、法律后果
协议离婚成功：
- 若双方成功协议离婚，将签订书面离婚协议，并亲自到婚姻登记机关申请离婚登记。离婚协议将载明双方自愿离婚的意思表示和对子女抚养、财产以及债务处理等事项协商一致的意见。
诉讼离婚判决：
- 若通过诉讼程序离婚，法院将根据实际情况作出判决。判决可能涉及离婚、子女抚养、财产分割等问题。双方需遵守法院的判决，履行相应的义务。
总结：与正在服用精神分裂症药物的配偶协议离婚是否合法，需根据配偶的具体民事行为能力状况来判断。若配偶具备完全民事行为能力，则协议离婚合法；若配偶属于无民事行为能力人或限制民事行为能力人，则需通过诉讼程序解决。在整个过程中，应注重保护精神病人的合法权益，确保法律程序的公正性和合理性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。