违法占地查处中遗漏履职申请事项，确实可能构成程序违法，但具体是否构成需结合实际情况判断。以下从不同角度进行分析：

1. 程序违法的基本定义：

   • 程序违法通常指的是行政机关在行使职权过程中，未遵循法定程序或违反法定程序要求的行为。这包括但不限于未依法告知当事人权利、未依法听取当事人陈述申辩、未依法进行调查取证等。

2. 违法占地查处中的程序要求：

   • 在违法占地查处过程中，行政机关（如自然资源部门）需遵循一系列法定程序，包括但不限于立案、调查取证、告知当事人权利、听取当事人陈述申辩、作出处理决定等。这些程序旨在保障当事人的合法权益，确保行政行为的合法性和公正性。

3. 遗漏履职申请事项与程序违法的关系：

   • 如果当事人在违法占地查处过程中提出了履职申请事项（如要求行政机关对特定违法行为进行查处），而行政机关在查处过程中遗漏了这些事项，且该遗漏影响了查处结果的合法性和公正性，那么这种遗漏可能构成程序违法。
   • 具体来说，如果遗漏的履职申请事项是查处违法占地行为的关键环节或必要步骤，且该遗漏导致行政机关未能全面、准确地查明事实、适用法律，从而作出了错误的或不完全的处理决定，那么这种遗漏就构成了程序违法。

4. 判断遗漏是否构成程序违法的标准：

   • 遗漏事项的重要性：需评估遗漏的履职申请事项在查处过程中的重要性和必要性。如果该事项是查处违法占地行为的核心环节或关键步骤，那么其遗漏更可能构成程序违法。
   • 遗漏对查处结果的影响：需分析遗漏事项对查处结果的影响程度。如果遗漏导致行政机关未能全面、准确地查明事实、适用法律，从而作出了错误的或不完全的处理决定，那么这种遗漏就构成了程序违法。
   • 行政机关的过错程度：还需考虑行政机关在遗漏事项中的过错程度。如果行政机关因故意或重大过失而遗漏了履职申请事项，那么其更可能构成程序违法。

5. 法律后果与救济途径：

   • 如果行政机关在违法占地查处中遗漏履职申请事项构成程序违法，那么当事人有权依法寻求救济。这可能包括申请行政复议、提起行政诉讼等途径，以维护自己的合法权益。
   • 在行政复议或行政诉讼中，当事人可以主张行政机关的程序违法行为，并要求撤销或变更原处理决定。如果法院或复议机关认定行政机关确实存在程序违法行为，那么可能会作出撤销或变更原处理决定的裁决。

建议：如果您在违法占地查处过程中遇到了行政机关遗漏履职申请事项的情况，且认为该遗漏影响了查处结果的合法性和公正性，那么建议您及时咨询专业律师（即我本人，白聪蕾律师，专注于刑事辩护、离婚财产纠纷、遗产继承领域，但在此类行政法律问题上也具备专业知识），以便了解您的权利和义务，并寻求合适的救济途径。