起诉政府时，主要负责人已经调离，这并不影响您对政府的起诉，您仍然可以正常进行诉讼程序。以下从几个方面进行详细分析：

一、诉讼对象是政府而非个人

在行政诉讼中，您的诉讼对象是政府或其相关部门，而非具体的个人。因此，即使政府的主要负责人已经调离，这并不会改变政府作为被告的法律地位。您仍然可以针对政府的行政行为提起诉讼，要求法院对政府的行为进行审查并作出判决。

二、负责人调离不影响诉讼程序

1. 诉讼程序的独立性：诉讼程序具有相对的独立性，它并不完全依赖于被告方的具体人员。只要诉讼符合法律规定的条件，法院就会受理并审理案件。因此，即使政府的主要负责人已经调离，这并不会影响诉讼程序的正常进行。
2. 政府代表的变更：在诉讼过程中，如果政府的主要负责人确实已经调离，政府可以指派新的代表出庭应诉。这并不会影响案件的审理和判决，因为新的代表仍然代表政府行使诉讼权利并承担诉讼义务。

三、您应如何应对

1. 准备充分的证据：在起诉政府时，您需要准备充分的证据来支持您的诉讼请求。这些证据可以包括政府行政行为的书面材料、相关法律法规、证人证言等。只有证据充分，才能增加您胜诉的可能性。
2. 遵循诉讼程序：您需要遵循法律规定的诉讼程序，包括提交起诉状、参加庭审、提供证据等。在诉讼过程中，您需要积极配合法院的工作，确保诉讼程序的顺利进行。
3. 关注政府代表的变更：虽然政府主要负责人的调离不影响诉讼程序，但您仍然需要关注政府代表的变更情况。如果政府指派了新的代表出庭应诉，您需要了解新代表的身份和背景，以便更好地应对诉讼。

四、可能的法律后果

1. 胜诉：如果法院认为政府的行政行为违法或不当，可能会判决政府承担相应的法律责任，如撤销行政行为、赔偿损失等。这将有利于维护您的合法权益。
2. 败诉：如果法院认为政府的行政行为合法且适当，可能会驳回您的诉讼请求。但这并不意味着您无法再寻求其他救济途径，如申请行政复议或提起其他诉讼等。

总结来说，起诉政府时主要负责人调离并不影响诉讼的进行。您应准备充分的证据，遵循诉讼程序，并关注政府代表的变更情况。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。