结论：在超过诉讼时效后，双方沟通同意以其他方式替代履行，一般情况下不直接构成诉讼时效的中断，但可能产生新的债权债务关系或视为对原债务的重新确认，从而影响诉讼时效的计算。以下从不同角度进行详细分析：

1. 诉讼时效中断的基本概念：

   • 诉讼时效中断是指在诉讼时效期间内，因发生法定事由，致使已经经过的时效期间归于无效，待中断事由消除后，诉讼时效期间重新计算。
   • 常见的诉讼时效中断事由包括：权利人向义务人提出履行请求、义务人同意履行义务、权利人提起诉讼或申请仲裁等。

2. 超过诉讼时效后的法律状态：

   • 一旦诉讼时效期间届满，权利人将丧失胜诉权，即法院将不再保护其权利主张，除非义务人自愿履行。
   • 在诉讼时效届满后，双方之间的债权债务关系在法律上不再受强制保护，但并不意味着债务本身消灭。

3. 沟通同意其他方式替代履行的影响：

   • 不直接构成中断：由于诉讼时效已经届满，单纯的沟通同意以其他方式替代履行，并不直接构成诉讼时效的中断。因为中断事由需要在诉讼时效期间内发生，而此时时效已届满。
   • 可能产生新的债权债务关系：如果双方通过沟通达成了新的协议，以其他方式替代原债务的履行，这可能构成一个新的债权债务关系。在这种情况下，新的债权债务关系将适用新的诉讼时效期间。
   • 视为对原债务的重新确认：在某些情况下，如果双方沟通同意以其他方式替代履行，且这种沟通可以视为对原债务的重新确认（如明确表示愿意继续履行原债务或承认原债务的存在），那么这可能被视为对原债务诉讼时效的“重启”或“重新计算”。但这种情况需要具体分析沟通的内容和方式，以及双方的真实意图。

4. 法律建议：

   • 明确沟通内容：在沟通同意以其他方式替代履行时，建议双方明确沟通的内容、方式和目的，以避免产生不必要的法律纠纷。
   • 签订书面协议：为了保障双方的权益，建议将沟通的内容以书面协议的形式固定下来，明确新的债权债务关系或原债务的重新确认情况。
   • 咨询专业律师：由于诉讼时效问题涉及复杂的法律判断和事实认定，建议在处理此类问题时咨询专业律师的意见，以确保自身权益得到妥善保护。

进一步思考：在实际操作中，诉讼时效问题往往与具体的案件事实和证据密切相关。因此，在处理涉及诉讼时效的纠纷时，除了考虑上述法律原则外，还需要结合具体的案件事实和证据进行综合分析。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。