员工在住院期间，即生病医疗期内被公司辞退，其赔偿情况确实需要根据辞退的合法性来确定。以下是对此问题的详细解答：
一、判断辞退是否合法
合法辞退的条件：
- 员工患病或非因工负伤，在规定的医疗期满后不能从事原工作，也不能从事由用人单位另行安排的工作。
- 公司需提前三十日以书面形式通知劳动者本人或者额外支付劳动者一个月工资后，方可解除劳动合同。
违法辞退的条件：
- 公司在员工生病医疗期内直接辞退员工，这属于违法解除劳动合同。
二、合法辞退的赔偿
经济补偿金：
- 按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。
- 六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，支付半个月工资的经济补偿。
- 月工资是指劳动者解除合同前十二个月的平均工资，若工作时间不足十二个月，则按实际月数平均计算。
医疗补助费：
- 用人单位还应给予不低于六个月工资的医疗补助费。
- 对患重病和绝症的，还应增加医疗补助费，患重病的增加部分不低于医疗补助费的百分之五十，患绝症的增加部分不低于医疗补助费的百分之百。
三、违法辞退的赔偿
继续履行合同：
- 员工可以要求公司继续履行劳动合同，恢复劳动关系，并补发辞退期间的工资。
支付赔偿金：
- 如果员工不要求继续履行劳动合同或者劳动合同已经不能继续履行的，公司应当依照经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。
- 赔偿金总额存在法定上限，月工资高于当地职工月平均工资三倍的，经济补偿年限最高不超过十二年，具体数额需结合地方规定确定。
四、维权途径
保留证据：
- 员工应妥善保存所有与请假、就医、工作以及辞退相关的证据，包括但不限于劳动合同、工资条、工作证、医院的诊断证明、病假条、辞退通知等。
友好协商：
- 员工可以尝试与公司进行友好协商，说明自身情况，要求公司按照法律规定支付相应补偿或赔偿。
申请调解：
- 如果协商不成，员工可以向本单位劳动争议调解委员会或依法设立的基层人民调解组织等申请调解。
劳动仲裁：
- 若调解无果，员工应在一年内的仲裁时效期间内向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，提交充分的证据来支持自己的主张。
提起诉讼：
- 对仲裁裁决不服的员工，可以自收到仲裁裁决书之日起十五日内向人民法院提起诉讼，准备更加充分的证据和法律依据来维护自己的权益。
综上所述，员工在住院期间被公司辞退时，应首先判断辞退的合法性，然后根据合法性来确定赔偿方式和数额。同时，员工应积极保留证据，通过友好协商、申请调解、劳动仲裁或提起诉讼等途径来维护自己的合法权益。