分居2年后再写离婚协议是有效的，但具体效力及后续影响需结合实际情况分析，以下从不同角度为你详细说明：

一、分居时间与离婚协议效力的关系

1. 分居时间本身不直接决定协议效力
   根据《民法典》规定，分居满2年是法院判决离婚的法定情形之一（需因感情不和且连续分居），但分居时间本身并不影响离婚协议的效力。无论分居多久，只要双方自愿签署离婚协议，且协议内容不违反法律强制性规定（如禁止性条款、损害第三方利益等），协议即具有法律效力。

2. 分居2年后签署协议的特殊性
   若双方已分居2年，可能感情已彻底破裂，此时签署离婚协议更易体现双方真实意愿。但需注意：

   • 若协议涉及财产分割、子女抚养等条款，需确保双方对财产状况、子女需求等有充分了解，避免因信息不对称导致协议显失公平；
     
   • 若一方在分居期间存在转移财产、隐匿财产等行为，协议中需明确约定违约责任，以保障另一方权益。

二、离婚协议生效的条件

1. 形式要件
   离婚协议需采用书面形式，并由双方签字或盖章确认。若仅口头约定，即使分居多年，协议也不具备法律效力。

2. 实质要件

   • 双方自愿：协议内容需是双方真实意思表示，不存在欺诈、胁迫等情形；
     
   • 内容合法：协议不得违反法律强制性规定（如禁止剥夺子女抚养权、约定“净身出户”等）；
     
   • 不损害第三方利益：协议不得涉及第三方财产或权益，否则可能被认定无效。

3. 登记生效
   离婚协议需经婚姻登记机关登记备案后生效。若仅签署协议但未办理离婚登记，协议不产生法律效力，双方仍为夫妻关系。

三、分居2年后签署协议的注意事项

1. 明确分居事实
   在协议中可注明“双方因感情不和已分居满2年”，作为感情破裂的证据，便于后续办理离婚登记或诉讼离婚时使用。

2. 细化财产分割条款
   分居期间双方可能各自管理财产，需在协议中明确：

   • 共同财产的范围（如房产、存款、投资等）；
     
   • 分割方式（如按比例分割、一方补偿另一方等）；
     
   • 债务承担（如共同债务由谁偿还、个人债务由谁承担等）。

3. 约定子女抚养条款
   若双方有子女，需在协议中明确：

   • 子女抚养权归属；
     
   • 抚养费金额及支付方式；
     
   • 探视权行使方式及时间。

4. 设置违约责任条款
   为防止一方反悔或拒不履行协议，可约定违约责任（如支付违约金、赔偿损失等），以增强协议的约束力。

四、分居2年后未签署协议的法律后果

若双方分居满2年但未签署离婚协议，任何一方均可向法院提起离婚诉讼。此时，法院将根据双方感情是否破裂、分居原因及时间等因素综合判断是否准予离婚。若法院判决离婚，未签署协议的一方可能面临财产分割、子女抚养等纠纷，需通过诉讼程序解决。

总结：分居2年后再写离婚协议是有效的，但需确保协议内容合法、双方自愿，并经婚姻登记机关登记备案。若对协议内容或签署流程有疑问，可直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业建议。