公职人员违规参与工程获得的利益，应当依法依规全部退赔，退赔方式及程序需根据具体违规情形及法律规定来确定。以下从不同角度详细阐述：

一、退赔的法律依据

1. 《中华人民共和国公务员法》：该法明确规定了公务员必须遵守的纪律，包括不得违反规定从事或者参与营利性活动，在企业或者其他营利性组织中兼任职务等。若公职人员违规参与工程，即违反了该法的相关规定，应当承担相应的法律责任，包括退赔违规所得。
2. 《中华人民共和国刑法》：若公职人员的违规行为构成犯罪，如贪污罪、受贿罪等，则需根据刑法的规定进行刑事处罚，并追缴其违法所得。退赔是刑事处罚的一部分，旨在恢复被破坏的社会关系和经济秩序。
3. 其他相关法律法规：如《中华人民共和国招标投标法》、《中华人民共和国建筑法》等，这些法律法规也对公职人员在工程建设领域的行为进行了规范，违反者同样需承担退赔等法律责任。

二、退赔的具体方式

1. 主动退赔：公职人员在发现自身违规参与工程并获得利益后，应主动向相关部门（如纪检监察机关、单位财务部门等）报告，并退赔全部违规所得。主动退赔可以体现公职人员的悔过态度，有助于减轻或免除其法律责任。
2. 强制退赔：若公职人员拒绝退赔或隐瞒违规所得，相关部门将依法进行调查取证，并通过法律程序强制其退赔。强制退赔可能涉及查封、扣押、冻结等措施，以确保违规所得能够被追回。

三、退赔的程序

1. 调查取证：相关部门在接到举报或发现公职人员违规参与工程后，将展开调查取证工作，收集相关证据以证明公职人员的违规行为及所得利益。
2. 认定违规：在调查取证的基础上，相关部门将根据法律法规的规定，认定公职人员的行为是否违规以及违规所得的具体数额。
3. 作出退赔决定：一旦认定公职人员违规并获得利益，相关部门将作出退赔决定，要求公职人员在规定期限内退赔全部违规所得。
4. 执行退赔：公职人员需按照退赔决定的要求，在规定期限内将违规所得退赔至指定账户或相关部门。若公职人员拒绝执行退赔决定，相关部门将依法采取强制措施。

四、退赔后的处理

1. 纪律处分：公职人员违规参与工程并获得利益，除退赔外，还将受到相应的纪律处分，如警告、记过、记大过、降级、撤职、开除等。
2. 刑事处罚：若公职人员的违规行为构成犯罪，还将依法追究其刑事责任，并可能面临有期徒刑、拘役、罚金等刑罚。

五、特殊情况的处理

1. 利益已转移或消耗：若公职人员已将违规所得转移给他人或已消耗殆尽，相关部门将依法追缴其等值财产或要求其承担相应的经济责任。
2. 涉及多人或复杂情况：若违规行为涉及多人或情况复杂，相关部门将成立专门工作组进行调查处理，确保退赔工作的顺利进行。

温馨提示：公职人员应严格遵守法律法规和职业道德规范，不得违规参与工程或谋取不正当利益。若发现自身存在违规行为，应主动向相关部门报告并退赔违规所得，以减轻或免除法律责任。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。