结论：股东会非100%表决通过时修改法人，需依据公司章程的具体规定以及相关法律法规来操作。若公司章程未明确规定修改法人的表决比例，则通常需遵循《公司法》中关于股东会决议的一般规定，即一般事项需经代表过半数表决权的股东通过，但修改法人可能涉及公司重大事项，部分情况下可能需要更高比例的表决权通过，具体需结合实际情况判断。
详细分析：
公司章程的规定：
- 公司章程是公司内部的“宪法”，它规定了公司的组织结构、运营方式以及股东会、董事会等机构的职权和议事规则。
- 如果公司章程中明确规定了修改法人所需的表决比例，那么股东会应当按照该比例进行表决。例如，章程可能规定修改法人需经全体股东三分之二以上表决权通过。
《公司法》的一般规定：
- 在公司章程未明确规定的情况下，应参照《公司法》的相关规定。
- 根据《公司法》的一般原则，股东会决议一般事项需经代表过半数表决权的股东通过。但修改法人可能被视为公司重大事项，部分情况下法律或司法实践可能要求更高比例的表决权通过，尽管《公司法》未直接规定修改法人的具体表决比例。
- 实际操作中，为确保决议的合法性和有效性，建议公司在修改法人时，尽量争取更高比例的股东同意，特别是当涉及公司控制权变更等重大事项时。
特殊情况下的处理：
- 如果公司存在控股股东或实际控制人，且其表决权足以影响决议结果，那么修改法人可能更容易实现。但这也可能引发其他股东的不满或争议，因此需谨慎处理。
- 在某些情况下，如果股东会无法就修改法人达成一致意见，可能需要通过诉讼或其他法律途径来解决争议。
法律建议：
- 在修改法人之前，建议公司先审查公司章程中关于修改法人的相关规定，确保股东会决议符合章程要求。
- 如果公司章程未明确规定或规定不明确，建议咨询专业律师或法律机构，了解当地法律实践和司法判例，以确定修改法人所需的表决比例。
- 在股东会决议过程中，应确保所有股东都有充分的机会表达意见和行使表决权，避免出现程序瑕疵或侵犯股东权益的情况。
- 如果修改法人涉及公司控制权变更等重大事项，建议提前与其他股东进行沟通协商，尽量达成共识，以减少后续争议和风险。
后续行动建议：
- 如果您正在面临修改法人的问题，且股东会无法达成一致意见，建议及时咨询专业律师，了解您的法律权益和可能的解决方案。
- 在修改法人过程中，务必遵守相关法律法规和公司章程的规定，确保决议的合法性和有效性。如有需要，可以请律师协助起草或审查相关法律文件。