核心结论：针对工人投诉钱已付清但不撤诉的情况，需分情况处理，具体如下：

1. 核实投诉内容与付款事实的一致性
   首先需确认工人投诉的具体事项（如工资拖欠、加班费争议等）与已付款项是否完全对应。若已付款项覆盖了投诉的全部诉求（例如通过银行转账备注“工资结清”或签订书面结清协议），则工人继续投诉可能缺乏事实依据。此时可要求工人提供未结清的证据，若其无法提供，可向劳动监察部门或仲裁机构说明情况，主张投诉不成立。

2. 检查付款凭证的合法性与完整性
   若已付款但未留存充分证据（如现金支付无收条、转账未备注用途），工人可能以“未收到款项”为由拒绝撤诉。此时需补充证据链：

   • 收集间接证据（如聊天记录、证人证言）证明付款事实；
     
   • 若工人曾书面确认收款（如签字确认的结清单），可作为关键证据提交；
     
   • 若付款方式存在瑕疵（如通过个人账户支付工资），需补充说明合理性（如公司授权代付）。

3. 通过行政或司法程序推动撤诉

   • 劳动监察部门介入：向当地劳动保障监察大队提交已付款证据，申请撤销投诉或终止调查。若工人坚持投诉，监察部门可能要求双方举证，最终以事实为依据作出处理；
     
   • 劳动仲裁反申请：若工人已申请仲裁且企业已付款，可在答辩中提出“诉求已实现”的抗辩，并提交付款凭证。仲裁委查明后可能驳回工人诉求；
     
   • 法院诉讼：若工人已起诉至法院，企业可提交付款证据主张“诉讼标的已消灭”，法院经审查后会裁定驳回起诉或判决驳回诉求。

4. 协商与法律威慑结合
   若工人因其他原因（如对付款金额有异议、存在其他未解决纠纷）拒绝撤诉，可尝试协商：

   • 明确告知工人继续投诉可能承担的法律责任（如虚假投诉可能面临行政处罚）；
     
   • 若工人存在恶意投诉，可保留证据（如录音、书面威胁材料）并反诉其侵犯名誉权或滥用诉权；
     
   • 协商时建议签订书面协议，明确“双方争议已一次性解决，工人不得再就此事主张权利”。

风险提示：若付款时未签订书面结清协议，工人可能以“部分款项未结清”或“付款与投诉无关”为由抗辩。因此，建议企业在处理劳动纠纷时，务必通过书面形式固定证据（如结清协议、收款确认书），避免口头约定。

如有进一步细节（如付款方式、投诉具体内容等），可向我补充说明，以便提供更精准的建议。