您好，关于您提到的“医院因结婚证不给新生儿开出生证明是否合法”的问题，我可以为您详细解答。

首先，我们需要明确的是，《出生医学证明》是依据《中华人民共和国母婴保健法》出具的，它是证明新生儿出生时健康、自然状况、血亲关系，以及申报国籍、户籍取得公民身份号码的法定医学证明。这份证明对于新生儿来说至关重要，是孩子的第一份人生档案。

接下来，我们来看办理《出生医学证明》的具体要求。根据相关规定，首次签发《出生医学证明》时，通常需要提供新生儿父母的有效身份证件原件、复印件，新生儿出生医学记录，以及出生医学证明签发知情告知书等材料。特别地，如果新生儿父母已经领取了结婚证，那么结婚证原件及复印件也是需要提供的材料之一。这是为了确认新生儿的血亲关系，确保出生证明的准确性和合法性。

然而，如果新生儿出生时无法提供其父母依法取得的《结婚证》，或者属于非婚生育的情况，而出生医学证明上需要填写父亲信息的，那么就需要提供新生儿父母的非婚生育说明及父子（女）亲子鉴定证明。这是为了在非婚生育的情况下，也能通过其他方式确认新生儿的血亲关系。

现在，我们回到您的问题上来。如果医院因为新生儿父母没有提供结婚证而拒绝开具出生证明，这在一定程度上是合理的，因为结婚证是确认新生儿血亲关系的重要依据之一。但是，如果新生儿父母确实无法提供结婚证，但能够提供其他能够证明血亲关系的材料（如非婚生育说明及亲子鉴定证明），那么医院应该根据这些材料来开具出生证明。

总的来说，医院在办理《出生医学证明》时，需要遵循相关的法律法规和规定，确保出生证明的准确性和合法性。如果新生儿父母因为特殊原因无法提供结婚证，但能够提供其他证明材料，医院应该根据实际情况来处理，而不是简单地拒绝开具出生证明。

希望这个解答能够帮助您更好地理解这个问题。如果您还有其他疑问或需要进一步的帮助，请随时告诉我。