建筑企业与个人签订的合作协议效力需分情况讨论，其有效性主要取决于协议内容、签订主体资格及是否违反法律强制性规定，具体分析如下：

1. 若协议内容合法且主体适格，则协议有效
   若合作协议内容不违反法律、行政法规的强制性规定（如未涉及非法转包、挂靠等违法行为），且双方主体具备民事行为能力（如个人具备完全民事行为能力，建筑企业具备合法经营资质），协议系双方真实意思表示，则协议自成立时生效，对双方具有法律约束力。
   法律依据：根据《民法典》第143条，民事法律行为有效的条件包括：行为人具有相应民事行为能力、意思表示真实、不违反法律或公序良俗。

2. 若协议涉及违法情形，则可能无效或部分无效

   • 非法转包或分包：若协议约定建筑企业将工程全部转包给无资质的个人，或个人以建筑企业名义承揽工程（挂靠），因违反《建筑法》第28条（禁止转包）、第26条（禁止无资质承揽工程）等强制性规定，协议可能被认定为无效。
     
   • 违反招投标规定：若工程属于必须招标的项目，但双方未通过招标程序直接签订合作协议，可能因违反《招标投标法》而无效。
     后果：协议无效后，双方需返还财产或折价补偿，有过错方需赔偿损失；若工程已完工且质量合格，可参照协议约定折价补偿（《民法典》第793条）。

3. 若协议存在可撤销情形，则可能被撤销
   若个人在签订协议时存在重大误解、欺诈、胁迫或显失公平等情形（如建筑企业隐瞒工程风险导致个人利益受损），个人可在法定期限内请求法院或仲裁机构撤销协议。
   法律依据：《民法典》第147-151条。

实务建议：

• 建筑企业应审查个人资质，避免与无资质个人合作；协议中明确约定权利义务、违约责任及争议解决方式。
  
• 个人在签订协议前应核实企业资质及工程合法性，保留协议原件及履行证据（如付款记录、沟通记录）。
  
• 若协议效力存疑，建议双方协商补充条款或通过法律途径确认效力，避免纠纷扩大。
  

如有具体协议条款或合作模式需分析，可进一步提供细节，我将结合实务经验为您详细解答。