结论：楼下商铺招牌和雨棚超过二楼商品房是否合法，需根据具体情况判断，主要涉及建筑物外立面使用、相邻权以及城市规划管理等方面的法律规定。以下从不同角度进行分析：
一、建筑物外立面使用规定
产权归属与使用权限：
- 通常情况下，建筑物外立面属于共有部分，其使用需遵循业主共同决定的原则。若商铺招牌和雨棚的安装未经二楼业主或其他相关业主同意，可能构成对共有部分的非法占用。
- 若外立面使用权限已通过业主公约、管理规约或相关合同明确划分，且商铺的安装行为符合这些规定，则可能是合法的。
安全与美观要求：
- 商铺招牌和雨棚的安装需确保建筑物的结构安全，不得影响建筑物的整体美观和城市风貌。若安装行为导致建筑物存在安全隐患或破坏城市景观，则可能违反相关法律法规。
二、相邻权保护
通风、采光与日照权：
- 若商铺招牌和雨棚的安装遮挡了二楼商品房的窗户，影响了其通风、采光或日照权，二楼业主有权要求商铺进行整改或拆除。
- 根据《民法典》中关于相邻权的规定，不动产的相邻权利人应当按照有利生产、方便生活、团结互助、公平合理的原则，正确处理相邻关系。
隐私权保护：
- 若商铺招牌或雨棚的安装位置过于接近二楼商品房的窗户或阳台，可能侵犯二楼业主的隐私权。二楼业主有权要求商铺采取相应措施保护其隐私。
三、城市规划与管理规定
城市规划要求：
- 商铺招牌和雨棚的安装需符合城市规划的要求，包括尺寸、颜色、材质等方面的规定。若安装行为违反城市规划，可能面临城市管理部门的处罚。
审批与备案程序：
- 在某些地区，商铺招牌和雨棚的安装需经过相关部门的审批或备案。若商铺未履行这些程序，其安装行为可能是非法的。
四、建议与措施
协商与调解：
- 建议二楼业主与商铺业主进行友好协商，寻求双方都能接受的解决方案。若协商无果，可寻求社区、物业或相关部门的调解。
法律途径：
- 若商铺的安装行为确实侵犯了二楼业主的合法权益，二楼业主有权通过法律途径维护自己的权益，包括提起民事诉讼或申请行政复议等。
总结：楼下商铺招牌和雨棚超过二楼商品房是否合法，需根据具体情况判断。若涉及对共有部分的非法占用、影响相邻权或违反城市规划与管理规定，则可能是非法的。建议二楼业主先与商铺业主进行协商，若协商无果，可寻求法律途径解决。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。