结论：是否会有案底取决于案件是否进入司法程序并被法院判决有罪。如果主任不追究责任，且案件未进入司法程序，则不会有案底；但如果案件已经进入司法程序，即使主任不追究，也可能会有案底。

详细分析：

1. 案底的定义：

   • 案底，通常指的是犯罪记录，即某人因犯罪行为被法院判决有罪后留下的记录。这种记录会被保存在公安机关的档案中，对个人的社会信用、就业、出国等方面可能产生一定影响。

2. 主任不追究责任的含义：

   • 主任不追究责任，可能意味着受害者（或单位）选择不报警、不提起刑事诉讼，或者即使报警后，也表示不追究犯罪嫌疑人的刑事责任。然而，这并不意味着案件就不会进入司法程序。

3. 案件进入司法程序的条件：

   • 即使受害者不追究，如果公安机关认为存在犯罪行为，且符合立案条件，他们仍然可以立案侦查。一旦立案，案件就会进入司法程序，包括侦查、审查起诉、审判等阶段。

4. 不同情况下的法律后果：

   • 情况一：如果主任不追究责任，且公安机关也未立案，那么案件就不会进入司法程序，犯罪嫌疑人就不会被法院判决有罪，因此不会有案底。
   • 情况二：如果主任不追究责任，但公安机关已经立案并侦查终结，将案件移送检察院审查起诉，检察院认为犯罪事实清楚、证据确实充分，决定提起公诉，那么案件就会进入审判阶段。如果法院判决犯罪嫌疑人有罪，那么就会留下案底。

5. 特殊情况：

   • 即使主任不追究责任，如果犯罪嫌疑人的行为构成犯罪，且公安机关已经掌握足够证据，那么公安机关仍然有权立案侦查。此外，如果犯罪嫌疑人的行为涉及其他受害者或公共利益，即使主任不追究，也可能有其他机构或个人提起诉讼。

建议：

• 如果你或你认识的人涉及此类情况，建议尽快咨询专业律师，了解具体的法律后果和应对策略。
• 如果案件尚未进入司法程序，且你希望避免留下案底，可以尝试与受害者协商解决，争取达成和解协议，并尽可能获得受害者的谅解。
• 如果案件已经进入司法程序，那么你需要积极配合律师的工作，提供必要的证据和信息，以维护自己的合法权益。

最后，每个案件的具体情况都有所不同，因此上述分析仅供参考。如果你有任何具体的法律问题或疑虑，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。