当单位认为行政机关的具体行政行为在考核等方面侵犯了其合法权益时，可以依法申请行政复议来维护自身权益。以下是详细的申请行政复议流程：
一、明确复议对象与复议机关
确定具体行政行为：
- 单位需要明确对哪个具体的行政行为（如考核决定、处罚决定等）不服，以及该行为是由哪个行政机关作出的。这是申请行政复议的前提和基础。
选择复议机关：
- 根据行政机关的层级和性质，选择正确的复议机关。一般来说：
- 对县级以上地方各级人民政府工作部门的具体行政行为不服的，可以向该部门的本级人民政府或上一级主管部门申请行政复议。
- 对地方各级人民政府的具体行政行为不服的，向上一级地方人民政府申请行政复议。
- 对海关、金融、外汇管理等实行垂直领导的行政机关和国家安全机关的具体行政行为不服的，向上一级主管部门申请行政复议。
- 对国务院部门或省、自治区、直辖市人民政府的具体行政行为不服的，向作出该行为的国务院部门或省、自治区、直辖市人民政府申请行政复议。
二、遵守申请期限
- 单位应在知道具体行政行为之日起六十日内提出行政复议申请。这是法定的申请期限，单位需要严格遵守。
- 若因不可抗力或其他正当理由耽误了法定申请期限，单位可以在障碍消除后继续计算申请期限，但需注意及时申请延长期限（通常需在障碍消除后的十日内提出申请）。
三、准备申请材料
行政复议申请书：
- 申请书应载明申请人的基本情况（包括单位名称、住所、邮政编码、法定代表人或主要负责人的姓名、职务等）、被申请人的名称、行政复议请求、主要事实和理由、申请人的签名或盖章以及申请日期。
- 申请书需要一式三份，以便复议机关、被申请人和申请人各留存一份。
证明材料：
- 单位主体资格证明，如营业执照副本复印件、法定代表人身份证明书等，以证明单位的合法身份和资格。
- 能够证明被申请行政复议的具体行政行为存在的证据材料，如考核决定书、处罚决定书等，以明确复议对象和内容。
- 支持单位复议请求和理由的相关证据材料，如合同、发票、鉴定报告等，以增强复议请求的说服力和可信度。
四、提交申请
- 单位可以通过当面递交或邮寄方式将申请材料提交给有管辖权的行政复议机关。
- 若选择邮寄方式，建议使用邮政挂号信或特快专递，并保留好邮寄凭证，以便查询和证明申请材料的送达情况。
五、后续处理与结果
受理审查：
- 复议机关将在收到申请后五日内进行审查。对不符合规定的申请，将决定不予受理并书面告知单位；对符合规定但不属于本机关受理的申请，将告知单位向有关行政复议机关提出。
审理决定：
- 行政复议原则上采取书面审查方式，但必要时复议机关可以向相关组织和人员调查情况，听取意见。
- 复议机关应在受理申请之日起六十日内作出行政复议决定（法律规定的期限少于六十日的除外）。情况复杂需延长时，经负责人批准可适当延长，但延长期限最多不超过三十日。
诉讼权利：
- 若单位对行政复议决定不服，可以依法向人民法院提起行政诉讼，以进一步维护自身合法权益。
通过以上步骤，单位可以依法有序地申请行政复议，维护自身在考核等方面的合法权益。在申请过程中，单位应确保申请材料的真实性和完整性，积极配合复议机关的审查工作，并关注后续处理与结果。