员工入职隐瞒怀孕，公司通常不能以此为由将其辞退。以下从多个角度为你详细分析：

一、法律依据层面

1. 《劳动合同法》第八条：用人单位在招用劳动者时有权了解与劳动合同直接相关的基本情况，但怀孕并不属于必须告知的基本信息。因此，员工隐瞒怀孕并不构成提供虚假信息，公司不能据此辞退员工。
2. 《劳动合同法》第四十二条：明确规定了女职工在孕期、产期、哺乳期内的特殊保护。用人单位不得依据该法第四十条（非过失性辞退，如劳动者患病或非因工负伤医疗期满后不能从事原工作等情形）和第四十一条（经济性裁员，如企业破产重整、生产经营发生严重困难等情形）的规定解除劳动合同。这意味着，在女职工处于“三期”内时，公司不能随意辞退。
3. 《劳动合同法》第三十九条：虽然规定了用人单位可以单方解除劳动合同的特定情形，如员工严重违反规章制度、严重失职等，但仅因隐瞒怀孕并不属于这些特定情形。因此，公司不能仅凭此点就辞退员工。

二、合理性分析层面

1. 隐瞒行为的普遍原因：员工可能因担心就业歧视而选择隐瞒怀孕。在现实中，部分用人单位对怀孕女性存在偏见，导致女性员工为了获得平等就业机会而暂时隐瞒。这种隐瞒行为并非出于恶意，而是为了维护自己的合法权益。
2. 怀孕属于个人隐私：怀孕是女性的基本权利和个人隐私，没有义务向单位如实告知。因此，隐瞒怀孕事实并不应被视为欺诈行为。公司不能以侵犯员工隐私为由辞退员工。
3. 工作能力与怀孕无直接关系：大多数情况下，怀孕女员工在孕期仍能够正常履行工作职责。因此，仅仅因为隐瞒怀孕而辞退员工是不合理的，也是违法的。

三、特殊情况与处理建议

1. 特殊岗位的考虑：如果员工所从事的岗位确实不适合孕妇（如需要长时间站立、搬运重物等），且公司在招聘时已明确告知岗位的特殊性，员工故意隐瞒怀孕并成功入职，公司可能有权依据《劳动合同法》第三十九条的规定单方解除劳动关系。但这种情况需要公司提供充分证据，证明员工明知岗位不适合孕妇仍故意隐瞒。
2. 应对措施建议：
   • 用人单位：发现员工隐瞒怀孕后，应以沟通和协商为主，合理安排工作任务和工作时间，确保员工能够在孕期正常工作。同时，加强内部管理，避免对怀孕女员工的歧视。如果确实需要辞退员工，必须确保存在合法理由，并按照法定程序进行。
   • 员工：虽然怀孕是个人隐私，但在合适的时机应主动向用人单位说明情况，以便用人单位做出合理安排。同时，员工也应遵守公司规章制度，认真履行工作职责，避免给公司造成不必要的损失。

四、法律后果层面

如果公司以员工隐瞒怀孕入职为由违法解除劳动合同，那么根据法律规定，公司需要承担双倍支付经济补偿金的法律责任。这不仅是对员工权益的保护，也是对用人单位违法行为的一种惩罚。

总结：员工入职时隐瞒怀孕事实，公司不能轻易将其辞退。公司应尊重员工的个人隐私和生育权利，遵守相关法律法规，确保员工的合法权益不受侵犯。同时，员工也应诚实透明地与公司沟通，共同维护和谐的劳动关系。如果你在这方面还有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。