结论前置：建设工程合同纠纷的管辖依据主要涉及级别管辖和地域管辖，其中地域管辖中特别强调了不动产专属管辖的原则。以下是对这一问题的详细解析：
一、级别管辖
级别管辖主要依据诉讼标的额来确定，不同级别的法院管辖不同标的额的案件。
基层人民法院：
- 大多数建设工程合同纠纷案件由基层人民法院管辖。
- 诉讼标的额较小的案件（具体标准因地区而异，如部分省份规定5亿元以下），一般由基层法院审理。
中级人民法院：
- 重大涉外案件、在本辖区有重大影响的案件以及最高人民法院确定由中级人民法院管辖的案件，由中级人民法院管辖。
- 部分省份规定，诉讼标的额在5亿元以上（含本数）的建设工程合同纠纷案件，可能由中级人民法院管辖。
高级人民法院和最高人民法院：
- 高级人民法院主要管辖本辖区内有重大影响的第一审民事案件，但实践中建设工程合同纠纷直接由高级人民法院管辖的情况较为少见。
- 最高人民法院则管辖在全国有重大影响的案件或认为应当由本院审理的案件。
二、地域管辖
地域管辖主要遵循“原告就被告”的一般原则，并考虑不动产专属管辖的规定。
一般地域管辖：
- 根据《民事诉讼法》的相关规定，因合同纠纷提起的诉讼，由被告住所地或者合同履行地人民法院管辖。
- 被告住所地是指被告的户籍所在地或经常居住地；合同履行地则需根据合同约定或实际履行情况确定，对于建设工程合同而言，合同履行地通常指的是工程所在地。
特殊地域管辖（不动产专属管辖）：
- 根据《民事诉讼法》及《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民事诉讼法〉的解释》的相关规定，建设工程施工合同纠纷按照不动产纠纷确定管辖，即由不动产所在地人民法院专属管辖。
- 不动产所在地即建设工程所在地，因此建设工程合同纠纷应由工程所在地的人民法院专属管辖。这一规定旨在便于法院调查取证、查明案情，并有利于案件的审理和执行。
三、其他注意事项
协议管辖：
- 合同双方可以在合同中约定争议解决方式及管辖法院，但不得违反级别管辖和专属管辖的规定。
- 若合同中有有效仲裁条款，则排除法院管辖，当事人应向约定的仲裁委员会申请仲裁。
管辖权异议：
- 当事人对管辖法院有异议的，应在提交答辩状期间提出管辖权异议申请。
- 法院将依法审查并作出裁定，对裁定不服的可提起上诉。
举例说明：假设某建设工程合同纠纷案件，诉讼标的额为3亿元，工程所在地在A省B市。根据级别管辖的规定，该案件可能由B市的中级人民法院管辖（具体需参照A省高级人民法院的相关规定）。同时，根据地域管辖中的不动产专属管辖原则，该案件应由B市的人民法院专属管辖。因此，无论从级别管辖还是地域管辖的角度来看，该案件都应由B市的中级人民法院管辖。
建议：在处理建设工程合同纠纷时，当事人应首先明确合同中的争议解决条款和管辖法院约定（如有），并了解相关法律法规和司法解释的规定。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。