原合同和补充协议的法人不一致，并不直接导致补充协议无效，其有效性主要取决于补充协议本身的合法性及双方的真实意愿。以下从几个关键角度进行详细分析：
法人变更与合同效力的关系：
- 法人的变更，包括法定代表人的变更，并不影响已经成立的合同的效力。合同一旦成立并生效，即对双方产生法律约束力，除非合同中有特别约定或法律另有规定。
- 补充协议作为对原合同的补充或变更，其效力同样不受法人变更的影响。只要补充协议是在双方自愿、平等、公平的基础上签订的，且内容不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，就应当认定为有效。
补充协议的有效性审查：
- 签订主体：补充协议的签订主体应当具有民事行为能力，且意思表示真实。如果补充协议是在胁迫、欺诈等非自愿情况下签订的，可能被视为无效。
- 内容合法性：补充协议的内容不得违反法律、行政法规的强制性规定，不得违背公序良俗。例如，补充协议中不得约定违法或损害国家、集体、第三人利益的内容。
- 程序合规性：如果原合同或补充协议对签订程序有特别要求（如需要董事会决议、股东会决议等），则补充协议的签订程序也应当符合这些要求。
法人不一致时的处理原则：
- 如果原合同和补充协议的法人（或法定代表人）不一致，但双方均认可补充协议的内容，且补充协议符合上述有效性审查的标准，那么补充协议仍然有效。
- 在这种情况下，双方应当按照补充协议的约定履行各自的义务。如果因法人不一致导致履行过程中出现争议，双方应当通过协商、调解、仲裁或诉讼等方式解决。
实际案例与法律适用：
- 假设原合同由A公司的原法定代表人签订，后来A公司的法定代表人变更为B，但A公司仍然认可并履行了与原合同相对方签订的补充协议。在这种情况下，补充协议的有效性不受法定代表人变更的影响。
- 如果补充协议中涉及到了法人变更后的权利义务调整（如变更了收款账户、交货地点等），且这些调整是双方自愿、平等、公平的基础上达成的，那么这些调整也是有效的。
建议与注意事项：
- 在签订补充协议时，双方应当明确约定补充协议与原合同的关系（如“本补充协议与原合同不一致之处，以本补充协议为准”），以避免未来可能出现的争议。
- 如果法人发生变更，新法人应当及时了解并确认原合同及补充协议的履行情况，确保合同的顺利履行。
- 在履行合同过程中，如果双方对合同条款或补充协议的内容产生争议，应当及时通过协商、调解等方式解决；如果无法协商解决，可以考虑通过仲裁或诉讼等方式维护自己的合法权益。
总之，原合同和补充协议的法人不一致并不直接导致补充协议无效。在判断补充协议的有效性时，应当综合考虑签订主体、内容合法性、程序合规性等多个因素。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。