补充协议主体和原协议主体不一致，其有效性需分情况讨论，具体如下：
若补充协议主体变更得到原协议各方同意：
- 有效性：在此情况下，补充协议是有效的。因为合同变更，包括合同主体的变更，通常需要合同各方当事人的协商一致。如果原协议的所有当事人都同意将补充协议的主体变更为新的主体，并且这种变更不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，那么补充协议就是合法有效的。
- 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，依法成立的合同，受法律保护，对当事人具有法律约束力。当事人协商一致，可以变更合同。因此，在各方同意的情况下，补充协议主体的变更并不影响其法律效力。
若补充协议主体变更未得到原协议各方同意：
- 有效性：此时，补充协议可能因缺乏原协议当事人的同意而无效。因为合同是双方或多方之间的法律行为，任何一方的变更都需要得到其他方的同意。如果未经原协议当事人同意，擅自变更补充协议的主体，可能构成对原合同的违约或侵权。
- 法律后果：如果补充协议主体变更未得到原协议各方同意，且该变更影响了原合同的履行或损害了其他方的利益，那么受损方有权要求违约方承担违约责任或侵权责任。这可能包括赔偿损失、继续履行合同、采取补救措施等。
特殊情况下的考虑：
- 表见代理或表见代表：在某些情况下，即使补充协议的主体与原协议不一致，但如果新主体能够构成表见代理或表见代表，即相对人有理由相信新主体有权代表原协议当事人签订补充协议，那么补充协议也可能被认定为有效。然而，这种情况需要严格的法律要件和证据支持。
- 合同转让：如果原协议当事人通过合法程序将合同权利义务转让给新主体，并且这种转让得到了原协议其他当事人的同意或符合法律规定的条件，那么新主体作为补充协议的当事人也是合法的。但这种情况下，通常需要签订专门的合同转让协议，并办理相关手续。
建议：
- 在签订补充协议时，务必确保所有原协议当事人都同意主体变更，并明确记录在补充协议中。
- 如果涉及合同转让或复杂法律关系，建议咨询专业律师以获取更准确的法律意见和指导。
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