结论前置：签订保密协议本身并不构成侵犯商业秘密罪，但违反保密协议中的保密义务，以不正当手段获取、披露、使用或允许他人使用商业秘密，且情节严重的，则可能构成侵犯商业秘密罪。

详细分析：

1. 保密协议与商业秘密的关系：

   • 保密协议是双方当事人之间就保密信息（往往包括商业秘密）的保密义务所达成的协议。它明确了双方在保密信息上的权利和义务，是保护商业秘密的一种重要手段。
   • 商业秘密则是指不为公众所知悉、具有商业价值并经权利人采取相应保密措施的技术信息、经营信息等商业信息。商业秘密的存在是保密协议保护的对象。

2. 违反保密协议与侵犯商业秘密的区别：

   • 法律性质不同：违反保密协议属于违约行为，主要依据合同法的相关规定承担违约责任；而侵犯商业秘密则属于侵权行为，受刑法、反不正当竞争法等法律的直接保护。
   • 构成要件不同：违反保密协议只需证明一方未履行保密义务即可，无需考虑信息的商业价值或秘密性；而侵犯商业秘密则需满足商业秘密的构成要件（秘密性、商业价值性、保密性），且行为人获取、使用或披露的手段必须是不正当的。
   • 法律后果不同：违反保密协议的法律后果主要是民事责任，如赔偿损失等；而侵犯商业秘密的法律后果则可能包括民事责任、行政责任甚至刑事责任，具体取决于行为的严重程度和造成的后果。

3. 签订保密协议后构成侵犯商业秘密罪的情形：

   • 尽管签订了保密协议，但如果一方以不正当手段（如盗窃、贿赂、欺诈、胁迫、电子侵入等）获取了权利人的商业秘密，并进行了披露、使用或允许他人使用，且情节严重的，则可能构成侵犯商业秘密罪。
   • 此外，如果一方违反保密协议中的保密义务，将商业秘密泄露给第三方或自行使用，给权利人造成重大损失的，也可能构成侵犯商业秘密罪。这里的“重大损失”通常涉及商业秘密的研发成本、利用周期、市场竞争状况变化等多个因素，需综合评估权利人因商业秘密被侵犯所遭受的经济损失或竞争优势的削弱程度。

4. 法律建议：

   • 对于企业而言，应加强保密协议的管理，确保保密协议内容明确、合法有效，并定期对执行情况进行检查和评估。
   • 提高商业秘密保护意识，加强员工对商业秘密保护的培训，增强保密意识，采取有效措施防止商业秘密被泄露或被不正当获取。
   • 一旦发现违反保密协议或侵犯商业秘密的行为，应及时收集证据并依法追究相关责任人的法律责任，以维护自身合法权益。

总结：签订保密协议是保护商业秘密的重要手段之一，但违反保密协议并不直接构成侵犯商业秘密罪。要构成侵犯商业秘密罪，必须满足特定的构成要件并达到“情节严重”的程度。因此，企业在日常经营中应全面理解保密协议与侵犯商业秘密的关系与区别，采取有效措施加强保密管理和商业秘密保护。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。