事业单位工作人员在病假期间，工资是否会被扣除需根据具体情况及国家相关法律法规来确定，并非一概而论。以下是对此问题的详细分析：
一、病假工资的基本规定
病假在2个月以内：
- 根据《关于国家机关工作人员病假期间生活待遇的规定》（国发〔1981〕52号）及相关政策，事业单位工作人员病假在2个月以内的，原工资全额发放，不作任何扣减。但需注意，单位可能根据内部规定扣发部分或全部的津贴、补贴和奖金。
病假超过2个月但不满6个月：
- 工作年限不满10年的，从第3个月起，工资按本人标准工资的90%计发。
- 工作年限满10年及以上的，工资照发，即不扣减。同样，津贴、补贴和奖金可能根据出勤情况被扣发。
病假超过6个月：
- 工作年限不满10年的，从第7个月起，工资按本人标准工资的70%计发。
- 工作年限满10年及以上的，按本人标准工资的80%计发。
- 特别说明：1945年9月2日以前参加革命工作的人员，病假期间工资按本人标准工资的90%计发。
二、病假工资的特殊情况
- 地方差异：各地区可能结合本地实际情况，对病假工资标准进行细微调整。例如，教育、卫生等特定类型的事业单位可能有专门规定。
- 荣誉称号：获得省级以上荣誉称号的工作人员，病假期间工资可适当提高，但需经相关部门批准。
- 疾病救济费：长期病假或非因工负伤的职工，还可能涉及疾病救济费的支付，具体比例依据工作年限和基本工资确定，且不得低于当地最低工资标准的80%。
三、病假期间的注意事项
- 提供医疗证明：职工在请病假前，应出示医院的疾病证明，以证明其确实因病需要请假。无故请病假者，用人单位有权驳回申请。
- 遵循请假程序：员工应按照单位的请假程序进行请假，并提供相应的医疗证明等材料。单位也应根据相关规定和员工的实际情况，合理处理病假工资问题。
- 咨询与反映：如果员工对病假工资的扣除有异议，可以向单位的人事部门或相关管理部门咨询和反映，以维护自己的合法权益。
四、实际案例与计算
假设某事业单位员工，工作年限为8年，月标准工资为5000元。若该员工病假3个月，则其病假工资计算如下：
- 第1、2个月：工资全额发放，即5000元/月。
- 第3个月：工资按本人标准工资的90%计发，即5000元 * 90% = 4500元。
因此，该员工3个月病假期间，总共应发放工资为：5000元 + 5000元 + 4500元 = 14500元。
总结与建议：
事业单位工作人员在病假期间的工资扣减问题，需综合考虑国家政策法规、地方实施细则以及单位内部规章制度。为确保自身权益不受损害，建议职工在请假前详细了解并遵守相关规定。同时，用人单位也应依法制定和执行扣薪标准，确保职工的合法权益得到保障。在具体操作中，如有疑问或争议，应及时查阅单位规章制度或咨询人事部门，必要时可向我咨询以获取更专业的法律建议。