结论：买到腰线房过了三年是否还能起诉，需根据具体情况判断，主要涉及诉讼时效、合同约定及房屋质量问题等多个方面。以下从不同角度进行详细分析：
一、诉讼时效角度
一般诉讼时效：根据《中华人民共和国民法典》第一百八十八条，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。这意味着，在一般情况下，如果购房者发现房屋存在问题，应在三年内提起诉讼。然而，这一时效并非绝对，还需考虑其他因素。
诉讼时效的起算点：诉讼时效通常从权利人知道或应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。对于腰线房问题，如果购房者在购买后三年内才发现房屋存在腰线设计导致的质量问题（如采光、通风受影响等），且能够证明此前并不知情，那么诉讼时效可能并未过期。
诉讼时效的中断与延长：在诉讼时效期间内，如果发生法定事由（如权利人向义务人提出履行请求、义务人同意履行义务等），诉讼时效可以中断并重新计算。此外，如果存在特殊情况（如权利人因不可抗力或其他障碍不能行使请求权），人民法院可以根据权利人的申请决定延长诉讼时效期间。
二、合同约定角度
合同条款：购房合同是购房者与开发商之间的重要法律文件。如果合同中明确约定了房屋的设计、结构、质量等标准，且腰线房的设计违反了这些约定，购房者有权依据合同要求开发商承担违约责任。此时，诉讼时效的计算可能受到合同条款的影响。
违约责任的追究：即使购房合同未明确约定腰线房问题，但如果开发商在销售过程中存在欺诈、隐瞒等行为，导致购房者购买了不符合预期的房屋，购房者仍可以依据《中华人民共和国民法典》中关于欺诈、隐瞒的规定追究开发商的违约责任。
三、房屋质量问题角度
房屋质量鉴定：如果购房者怀疑腰线房存在质量问题（如结构安全、防水性能等），可以委托专业机构进行房屋质量鉴定。如果鉴定结果显示房屋确实存在质量问题，且该问题与腰线设计有关，购房者有权要求开发商进行修复或赔偿。
质量问题的诉讼时效：对于房屋质量问题，诉讼时效的计算可能因具体情况而异。如果质量问题在购房后三年内被发现，且购房者能够证明此前并不知情，那么诉讼时效可能并未过期。此外，如果质量问题持续存在且未得到解决，诉讼时效可能从问题得到解决之日起重新计算。
四、建议与行动
收集证据：如果购房者认为腰线房存在问题且可能涉及诉讼，应尽快收集相关证据（如购房合同、房屋照片、质量鉴定报告等），以便在诉讼中证明自己的主张。
咨询专业律师：由于法律问题具有复杂性和专业性，购房者应咨询专业律师以获取更具体的法律建议。律师可以根据购房者的具体情况和证据材料，评估诉讼风险并提供相应的法律策略。
考虑和解或调解：在提起诉讼前，购房者也可以考虑与开发商进行和解或调解。通过协商达成一致意见可以节省时间和成本，并避免不必要的法律纠纷。
综上所述，买到腰线房过了三年是否还能起诉需根据具体情况判断。如果购房者能够证明自己在购买后三年内才发现房屋存在问题且诉讼时效未过期，或者合同中有明确约定且开发商存在违约行为，或者房屋存在质量问题且与腰线设计有关，那么购房者仍有权提起诉讼。如有具体法律问题，可直接向我咨询。