关于双方宅基地互换在镇政府不知情、村主任主持下签订的私下协议是否有效的问题，结论如下：

1. 协议效力需分情况讨论：

   • 若互换行为符合法定条件：根据《民法典》及相关宅基地管理规定，宅基地互换若满足以下条件，即使未事先告知镇政府，协议仍可能被认定为有效：
     • 双方为同一集体经济组织成员（即同村村民）；
     • 互换后未改变土地用途（仍用于宅基地建设）；
     • 互换行为经村集体经济组织或村民委员会同意（村主任主持可能视为村集体同意的初步证据）；
     • 互换后依法办理了宅基地使用权变更登记（若未登记，可能影响物权效力，但不影响合同效力）。
   • 若互换行为存在违法情形：若互换双方非同一集体经济组织成员，或互换后改变土地用途（如用于商业开发），则协议可能因违反法律强制性规定而被认定无效。

2. 镇政府不知情的影响：

   • 宅基地互换虽需报乡镇政府备案，但备案并非协议生效的法定要件。未告知镇政府可能导致行政处罚（如责令改正），但不影响民事协议的效力。
   • 若镇政府事后追认或补办手续，可进一步巩固协议效力。

3. 村主任主持的效力：

   • 村主任作为村集体负责人，其主持互换行为可能被视为村集体同意的表示。但若村主任超越职权或未履行法定程序（如未召开村民会议讨论），可能影响协议的合法性。
   • 建议核实村主任主持行为是否符合村集体决策程序（如村民会议或村民代表会议决议）。

法律建议：

• 完善手续：若互换行为合法，建议双方尽快补办宅基地使用权变更登记，并向镇政府备案，以避免后续纠纷。
• 协商解决：若协议存在瑕疵，双方可协商补充协议或重新签订合法协议。
• 法律途径：若协商无果，可向法院提起诉讼，请求确认协议效力或解决纠纷。

可能后果：

• 若协议有效，双方应继续履行；若无效，可能需恢复原状或赔偿损失。
• 若涉及行政处罚，可能面临罚款或土地收回等风险。

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