结论：关于从租赁公司租的汽车用于运输盗窃赃物，该作案车辆是否能被法院没收，这主要取决于车辆是否被认定为犯罪工具以及相关法律规定。一般情况下，如果车辆被认定为犯罪工具，且符合法律规定的没收条件，那么车辆是有可能被法院没收的。以下从多个角度进行详细分析：
一、车辆是否构成犯罪工具
犯罪工具的定义：
- 犯罪工具通常指的是在犯罪过程中被直接用于实施犯罪行为的物品或手段。在盗窃案件中，如果车辆被用于运输赃物，且这种运输行为是盗窃犯罪不可或缺的一部分，那么车辆有可能被认定为犯罪工具。
车辆在犯罪中的作用：
- 需要分析车辆在盗窃犯罪中的具体作用。如果车辆仅仅是作为交通工具，且没有直接参与盗窃行为（如撬锁、搬运等），那么其被认定为犯罪工具的可能性相对较低。但如果车辆被用于运输赃物，且这种运输是盗窃犯罪的关键环节，那么车辆更有可能被认定为犯罪工具。
二、法律规定的没收条件
相关法律规定：
- 根据《中华人民共和国刑法》第六十四条的规定，犯罪分子违法所得的一切财物，应当予以追缴或者责令退赔；对被害人的合法财产，应当及时返还；违禁品和供犯罪所用的本人财物，应当予以没收。没收的财物和罚金，一律上缴国库，不得挪用和自行处理。
没收条件的应用：
- 在本案中，如果车辆被认定为犯罪工具，且属于供犯罪所用的本人财物（尽管车辆是租赁的，但在此情境下，可视为犯罪分子为实施犯罪而使用的财物），那么根据法律规定，车辆是有可能被没收的。但需要注意的是，如果租赁公司能够证明其对车辆被用于犯罪并不知情，且没有过错，那么租赁公司可能有权要求返还车辆或获得相应赔偿。
三、实际案例与司法实践
实际案例：
- 在司法实践中，对于类似案件的处理往往取决于具体案情和证据。如果车辆被明确用于运输赃物，且没有其他合法用途，那么法院更有可能判决没收车辆。
司法实践中的考量因素：
- 法院在判决时还会考虑其他因素，如车辆的价值、犯罪情节的严重程度、犯罪分子的主观恶性等。如果车辆价值较高，且犯罪情节严重，那么法院更有可能判决没收车辆以体现法律的威严和公正。
四、建议与应对措施
对于租赁公司：
- 租赁公司应加强对租车人的身份审核和租车用途的询问，以降低车辆被用于犯罪的风险。同时，一旦发现车辆被用于犯罪活动，应立即报警并配合警方调查。
对于租车人：
- 租车人应遵守法律法规，不得将租赁车辆用于任何违法犯罪活动。如果因个人原因导致车辆被没收或产生其他法律后果，租车人将承担相应的法律责任。
法律途径：
- 如果车辆被没收或面临没收风险，相关当事人（如租赁公司或租车人）可以通过法律途径维护自己的合法权益。例如，租赁公司可以提起民事诉讼要求犯罪分子赔偿损失；租车人可以提出抗辩或申诉以争取减轻或免除法律责任。
最后，每个案件的具体情况都有所不同，因此在实际操作中需要结合具体案情和法律规定进行综合分析。如果您或您身边的人遇到类似问题，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供详细的法律建议。