在双方达成调解协议后，诉讼费的计算通常是以调解协议确定的标的额为基础，而非起诉时的标的额，但具体还需结合案件实际情况与法院规定来确定。以下是对这一问题的详细分析：
一、诉讼费计算的一般原则
诉讼费，即当事人进行民事诉讼依法应当向人民法院交纳的费用，其计算通常依据案件的性质、标的额大小以及诉讼程序等因素来确定。在合同纠纷等民事案件中，诉讼费一般按照诉讼请求的金额或者价额，按照一定比例分段累计交纳。
二、调解协议对诉讼费计算的影响
调解协议标的额作为计算基础：
- 当双方达成调解协议时，该协议通常会对争议事项进行明确，并确定双方的权利义务，包括可能的赔偿金额、履行方式等。在此情况下，诉讼费的计算往往会以调解协议中确定的标的额为基础。
- 这是因为调解协议是双方自愿达成的，具有法律约束力，且反映了双方对争议事项的实际解决意愿和结果。因此，以调解协议标的额计算诉讼费，更符合案件的实际情况和公平原则。
起诉标的额的参考作用：
- 尽管起诉时的标的额是诉讼费计算的一个初始参考点，但在双方达成调解协议后，其作用通常会被调解协议所取代。
- 起诉标的额可能因双方争议焦点、证据情况等因素而有所变化，而调解协议则是双方在综合考虑各种因素后达成的共识，因此更具有实际意义。
三、特殊情况下的诉讼费计算
调解协议部分履行或变更：
- 如果调解协议在履行过程中发生部分履行或变更的情况，诉讼费的计算可能会相应调整。例如，如果一方只履行了调解协议中的部分义务，那么诉讼费可能会根据实际履行的标的额来重新计算。
法院对诉讼费的裁量权：
- 在某些情况下，法院可能会根据案件的具体情况，如双方的经济状况、争议事项的复杂性等，对诉讼费的计算进行一定的裁量。这通常发生在调解协议标的额与起诉标的额存在较大差异，且法院认为有必要进行调整时。
四、实际操作建议
在达成调解协议时明确诉讼费承担：
- 为了避免后续争议，双方在达成调解协议时，可以明确约定诉讼费的承担方式和金额。这样不仅可以减少不必要的纠纷，还可以确保诉讼费的计算更加透明和公正。
咨询法院或专业律师：
- 由于诉讼费的计算可能因地区、案件类型等因素而有所不同，因此在具体操作中，建议咨询当地法院或专业律师以获取准确的指导和建议。
总结来说，在双方达成调解协议后，诉讼费的计算通常是以调解协议确定的标的额为基础。但具体还需结合案件实际情况与法院规定来确定。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。