结论：在最高院的相关司法实践中，当出借人银行转账与借条金额不一致时，出借人确实需要对每笔转账是否构成民间借贷本金承担举证责任。以下是对这一问题的详细分析：
一、法律背景与原则
在民间借贷纠纷中，借条作为证明借贷关系存在及借款金额的重要证据，具有较高的证明力。然而，当借条上记载的金额与出借人实际转账的金额不一致时，就产生了举证责任分配的问题。根据《最高人民法院关于审理民间借贷案件适用法律若干问题的规定》的相关精神，出借人需要就其主张的借款金额提供充分的证据予以证明，这包括但不限于借条、转账记录、收条等。
二、举证责任的具体分配
出借人举证：
- 出借人需要证明其实际出借的金额与借条上记载的金额相符，或者证明借条上记载的金额中包含了其他合法合理的费用（如利息、手续费等，但需符合法律规定）。
- 如果出借人主张的借款金额大于实际转账金额，出借人需要解释差额部分的原因，并提供相应证据。例如，差额部分可能是预先扣除的利息、手续费，或者是以现金方式交付的借款等。
借款人抗辩与举证：
- 如果借款人对出借人主张的借款金额提出异议，借款人需要提供相反证据予以反驳。例如，借款人可以提供转账记录、收条等证据证明实际收到的借款金额少于借条上记载的金额。
- 借款人还可以主张借条上的金额包含了非法利息或其他不合理费用，并要求法院予以扣除。
三、司法实践中的具体应用
在司法实践中，法院会根据双方提供的证据进行综合判断。如果出借人无法提供充分证据证明其主张的借款金额，或者借款人提供的证据足以反驳出借人的主张，法院可能会根据实际转账金额认定借款本金。
举例说明：
- 假设借条上记载的借款金额为10万元，但出借人实际只转账了8万元。在诉讼中，出借人需要解释这2万元的差额部分，并提供相应证据。如果出借人无法提供充分证据，法院可能会认定借款本金为8万元。
- 如果借款人主张借条上的10万元中包含了2万元的非法利息，并提供了相关证据（如双方之前的聊天记录、其他借款合同等），法院在审查后可能会扣除这2万元，认定借款本金为8万元。
四、法律建议
对于出借人：
- 在签订借条时，应确保借条上记载的金额与实际转账金额一致。
- 如果存在预先扣除利息、手续费等情况，应在借条上明确注明，并保留相关证据。
- 在诉讼中，应积极提供转账记录、收条等证据证明自己的主张。
对于借款人：
- 在收到借款时，应仔细核对借条上记载的金额与实际收到的金额是否一致。
- 如果发现不一致或存在其他问题，应及时与出借人沟通并保留相关证据。
- 在诉讼中，应积极提供相反证据反驳出借人的主张。
如有任何关于债务债权（民间借贷）方面的疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。