专属管辖案件在一般情况下不能约定仲裁，但在特定情形下，若法律未明确禁止且当事人达成有效仲裁协议，仍可能通过仲裁解决。以下是对这一问题的详细分析：
一、专属管辖的定义与特点
专属管辖是法律强制规定某类案件只能由特定法院管辖，其他法院无管辖权，且当事人也不能协议变更管辖法院。这类案件通常涉及特定的地域或法律关系，如不动产纠纷、港口作业中发生的纠纷等。专属管辖的目的在于维护司法确定性和专业性，确保特定类型案件得到恰当处理。
二、仲裁的性质与适用
仲裁是一种双方自愿选择的争议解决方式，需要双方达成明确的仲裁协议，将争议提交给选定的仲裁机构进行裁决。仲裁具有自愿性、灵活性、专业性等特点，是当事人意思自治原则的体现。然而，仲裁的适用也受到法律的限制，并非所有类型的纠纷都可以通过仲裁解决。
三、专属管辖与仲裁的关系分析
一般原则：
- 专属管辖的案件具有排他性，一旦案件被确定为专属管辖，就排除了其他法院或仲裁机构的管辖权。因此，在一般情况下，当事人不能通过约定来选择仲裁作为专属管辖案件的争议解决方式。这种约定很可能是无效的，因为仲裁机构通常也不会接受违反专属管辖规定的仲裁申请。
特殊情形：
- 并非所有专属管辖的案件都绝对排除仲裁。例如，在建设工程施工合同纠纷中，虽然按照《中华人民共和国民事诉讼法》的规定，这类纠纷属于专属管辖，由不动产所在地人民法院管辖；但如果建设工程合同双方当事人在合同中约定了有效的仲裁条款，并且该约定不违反法律的强制性规定，那么当双方就合同履行等问题发生争议时，可以按照仲裁条款的约定，将纠纷提交给约定的仲裁机构进行仲裁。这体现了法律对当事人意思自治的尊重，但这种情况属于例外，并不普遍适用。
四、实际操作建议
明确案件类型和法律规定：
- 在处理专属管辖案件时，当事人应首先明确案件的具体类型和法律规定。如果案件确实属于专属管辖范围，且法律未明确允许通过仲裁解决，则应遵循法律规定的诉讼程序来解决争议。
审查仲裁条款的有效性和合法性：
- 如果案件存在特殊情形，如上述建设工程施工合同纠纷中的仲裁约定，当事人应仔细审查仲裁条款的有效性和合法性。确保仲裁条款不违反法律的强制性规定，且双方意思表示真实、明确。
咨询专业意见：
- 由于专属管辖和仲裁都是复杂的法律问题，当事人在处理相关纠纷时，如有疑问或不确定，可以直接向我咨询，我会根据具体案件情况和法律规定，为你提供准确的法律意见和帮助。
五、法律后果
- 如果当事人在专属管辖案件中约定了仲裁条款，但该条款违反了法律的强制性规定或专属管辖的规定，那么该仲裁条款将被视为无效。当一方当事人向法院提起诉讼时，法院会以专属管辖为由受理案件，而不考虑仲裁协议的存在。
- 即使仲裁机构作出了裁决，由于专属管辖案件的特殊性，该裁决也可能无法得到有效的执行。因为专属管辖的法院对案件具有排他性的管辖权，其他法院（包括仲裁机构所在地的法院）通常不会承认和执行与该专属管辖相冲突的仲裁裁决。
综上所述，专属管辖案件在一般情况下不能约定仲裁，但在特定情形下，若法律未明确禁止且当事人达成有效仲裁协议，仍可能通过仲裁解决。因此，在实际操作中，当事人应根据具体案件情况和法律规定来选择合适的争议解决方式。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。