结论前置：别人骑您的摩托车闯红灯，扣分应当扣在实际驾驶人的驾驶证上，遵循“谁开车谁负责”的原则。若无法确定实际驾驶人，则可能会依据具体情况对车辆所有人（即您）进行处罚。

详细分析如下：

1. 能确定实际驾驶人的情况：

   • 现场查处：如果在违章时被交警现场拦下并开具处罚决定书，交警会直接记录实际驾驶人的驾驶证信息。此时，闯红灯的扣分将明确记在实际驾驶人的驾驶证上。
   • 主动处理违章：当交通技术监控设备（如电子眼）记录到摩托车闯红灯违法行为后，如果实际驾驶人主动前往交警队处理违章，并提供自己的驾驶证，那么扣分同样会记在实际驾驶人的驾驶证上。

2. 无法确定实际驾驶人的情况：

   • 车主责任：如果摩托车闯红灯被电子眼抓拍，但您无法明确指出当时具体是谁驾驶车辆，部分地方的交警部门可能会默认将违章扣分记在您的驾驶证上。这是因为您对自己的车辆负有管理责任，需要确保车辆合法使用，避免被他人用于违法活动。不过，这种情况并非绝对，具体处理方式可能因地区和具体情况而有所差异。

法律依据与处罚措施：

• 根据《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，机动车驾驶人违反道路交通安全法律、法规关于道路通行规定的，将面临警告或二十元以上二百元以下罚款，并可能面临记分等处罚措施。
• 具体扣分情况依据《道路交通安全违法行为记分管理办法》来执行。例如，驾驶机动车不按交通信号灯指示通行的（即闯红灯），一次将记6分。

建议与提醒：

• 及时处理违章：为了避免不必要的麻烦和损失，实际驾驶人应及时处理自己造成的违章行为，缴纳罚款并接受相应的记分处罚。
• 车主谨慎借车：您在将摩托车借给他人时，应谨慎选择借用人，并确保其具备合法的驾驶资格和遵守交通规则的意识。同时，也应提醒借用人注意行车安全，遵守交通规则。
• 保留证据：如果可能的话，您可以要求借用人提供身份证明和驾驶证复印件，以便在发生违章时能够明确责任。

特殊情况说明：

• 如果借用人拒绝承担违章责任，或者您无法联系到借用人，您可能需要承担一定的法律责任。在这种情况下，您可以考虑通过法律途径来维护自己的权益，比如向法院提起诉讼要求借用人承担违章责任。

总之，别人骑您的摩托车闯红灯，扣分原则上是扣在实际驾驶人的驾驶证上的。但在无法确定实际驾驶人的情况下，您可能需要承担一定的责任。因此，无论是驾驶人还是车主，都应严格遵守交通规则，确保行车安全。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。